Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHS4

CLHC1, Clathrin heavy chain linker domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLHC1Q8NHS4 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLHC1Q8NHS4 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLHC1Q8NHS4 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLHC1Q8NHS4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLHC1Q8NHS4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLHC1Q8NHS4 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLHC1Q8NHS4 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CLHC1Q8NHS4 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLHC1Q8NHS4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLHC1Q8NHS4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLHC1Q8NHS4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLHC1Q8NHS4 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLHC1Q8NHS4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLHC1Q8NHS4 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLHC1Q8NHS4 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLHC1Q8NHS4 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLHC1Q8NHS4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLHC1Q8NHS4 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLHC1Q8NHS4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLHC1Q8NHS4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLHC1Q8NHS4 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLHC1Q8NHS4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLHC1Q8NHS4 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLHC1Q8NHS4 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLHC1Q8NHS4 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLHC1Q8NHS4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLHC1Q8NHS4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLHC1Q8NHS4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLHC1Q8NHS4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLHC1Q8NHS4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLHC1Q8NHS4 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLHC1Q8NHS4 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLHC1Q8NHS4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLHC1Q8NHS4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLHC1Q8NHS4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLHC1Q8NHS4 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLHC1Q8NHS4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLHC1Q8NHS4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLHC1Q8NHS4 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLHC1Q8NHS4 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLHC1Q8NHS4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLHC1Q8NHS4 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLHC1Q8NHS4 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLHC1Q8NHS4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLHC1Q8NHS4 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLHC1Q8NHS4 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLHC1Q8NHS4 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CLHC1Q8NHS4 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLHC1Q8NHS4 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLHC1Q8NHS4 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLHC1Q8NHS4 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLHC1Q8NHS4 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLHC1Q8NHS4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLHC1Q8NHS4 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLHC1Q8NHS4 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLHC1Q8NHS4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLHC1Q8NHS4 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CLHC1Q8NHS4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLHC1Q8NHS4 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLHC1Q8NHS4 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLHC1Q8NHS4 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLHC1Q8NHS4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLHC1Q8NHS4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLHC1Q8NHS4 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLHC1Q8NHS4 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLHC1Q8NHS4 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLHC1Q8NHS4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLHC1Q8NHS4 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLHC1Q8NHS4 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLHC1Q8NHS4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLHC1Q8NHS4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLHC1Q8NHS4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLHC1Q8NHS4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLHC1Q8NHS4 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLHC1Q8NHS4 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLHC1Q8NHS4 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLHC1Q8NHS4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLHC1Q8NHS4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLHC1Q8NHS4 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLHC1Q8NHS4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLHC1Q8NHS4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLHC1Q8NHS4 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLHC1Q8NHS4 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLHC1Q8NHS4 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLHC1Q8NHS4 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLHC1Q8NHS4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLHC1Q8NHS4 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLHC1Q8NHS4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLHC1Q8NHS4 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CLHC1Q8NHS4 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLHC1Q8NHS4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLHC1Q8NHS4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLHC1Q8NHS4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLHC1Q8NHS4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLHC1Q8NHS4 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLHC1Q8NHS4 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLHC1Q8NHS4 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLHC1Q8NHS4 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLHC1Q8NHS4 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLHC1Q8NHS4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms