Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFH3

NUP43, Nucleoporin Nup43, humanhuman

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP43Q8NFH3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUP43Q8NFH3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUP43Q8NFH3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUP43Q8NFH3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUP43Q8NFH3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUP43Q8NFH3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUP43Q8NFH3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUP43Q8NFH3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUP43Q8NFH3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUP43Q8NFH3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUP43Q8NFH3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUP43Q8NFH3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NUP43Q8NFH3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUP43Q8NFH3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NUP43Q8NFH3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUP43Q8NFH3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUP43Q8NFH3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUP43Q8NFH3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUP43Q8NFH3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUP43Q8NFH3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NUP43Q8NFH3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUP43Q8NFH3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NUP43Q8NFH3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUP43Q8NFH3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUP43Q8NFH3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUP43Q8NFH3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUP43Q8NFH3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NUP43Q8NFH3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUP43Q8NFH3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NUP43Q8NFH3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUP43Q8NFH3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUP43Q8NFH3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUP43Q8NFH3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUP43Q8NFH3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUP43Q8NFH3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUP43Q8NFH3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NUP43Q8NFH3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUP43Q8NFH3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUP43Q8NFH3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUP43Q8NFH3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUP43Q8NFH3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUP43Q8NFH3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUP43Q8NFH3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUP43Q8NFH3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUP43Q8NFH3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUP43Q8NFH3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUP43Q8NFH3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUP43Q8NFH3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUP43Q8NFH3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUP43Q8NFH3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NUP43Q8NFH3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUP43Q8NFH3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NUP43Q8NFH3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NUP43Q8NFH3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NUP43Q8NFH3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NUP43Q8NFH3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NUP43Q8NFH3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NUP43Q8NFH3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NUP43Q8NFH3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUP43Q8NFH3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUP43Q8NFH3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUP43Q8NFH3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUP43Q8NFH3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NUP43Q8NFH3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUP43Q8NFH3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUP43Q8NFH3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUP43Q8NFH3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUP43Q8NFH3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUP43Q8NFH3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUP43Q8NFH3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUP43Q8NFH3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NUP43Q8NFH3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUP43Q8NFH3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUP43Q8NFH3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUP43Q8NFH3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUP43Q8NFH3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUP43Q8NFH3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NUP43Q8NFH3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUP43Q8NFH3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUP43Q8NFH3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUP43Q8NFH3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUP43Q8NFH3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUP43Q8NFH3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NUP43Q8NFH3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUP43Q8NFH3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUP43Q8NFH3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUP43Q8NFH3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUP43Q8NFH3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUP43Q8NFH3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUP43Q8NFH3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUP43Q8NFH3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUP43Q8NFH3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUP43Q8NFH3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUP43Q8NFH3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUP43Q8NFH3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUP43Q8NFH3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUP43Q8NFH3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
NUP43Q8NFH3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NUP43Q8NFH3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NUP43Q8NFH3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms