Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEZ2

VPS37A, Vacuolar protein sorting-associated protein 37A, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS37AQ8NEZ2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VPS37AQ8NEZ2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
VPS37AQ8NEZ2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VPS37AQ8NEZ2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VPS37AQ8NEZ2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VPS37AQ8NEZ2 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VPS37AQ8NEZ2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VPS37AQ8NEZ2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VPS37AQ8NEZ2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VPS37AQ8NEZ2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VPS37AQ8NEZ2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VPS37AQ8NEZ2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VPS37AQ8NEZ2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VPS37AQ8NEZ2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VPS37AQ8NEZ2 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VPS37AQ8NEZ2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VPS37AQ8NEZ2 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VPS37AQ8NEZ2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VPS37AQ8NEZ2 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VPS37AQ8NEZ2 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VPS37AQ8NEZ2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VPS37AQ8NEZ2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VPS37AQ8NEZ2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VPS37AQ8NEZ2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VPS37AQ8NEZ2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VPS37AQ8NEZ2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VPS37AQ8NEZ2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VPS37AQ8NEZ2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VPS37AQ8NEZ2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VPS37AQ8NEZ2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VPS37AQ8NEZ2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VPS37AQ8NEZ2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VPS37AQ8NEZ2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VPS37AQ8NEZ2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VPS37AQ8NEZ2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VPS37AQ8NEZ2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VPS37AQ8NEZ2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VPS37AQ8NEZ2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VPS37AQ8NEZ2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VPS37AQ8NEZ2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VPS37AQ8NEZ2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VPS37AQ8NEZ2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VPS37AQ8NEZ2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VPS37AQ8NEZ2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VPS37AQ8NEZ2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
VPS37AQ8NEZ2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
VPS37AQ8NEZ2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VPS37AQ8NEZ2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VPS37AQ8NEZ2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VPS37AQ8NEZ2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
VPS37AQ8NEZ2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VPS37AQ8NEZ2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
VPS37AQ8NEZ2 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VPS37AQ8NEZ2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VPS37AQ8NEZ2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
VPS37AQ8NEZ2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VPS37AQ8NEZ2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VPS37AQ8NEZ2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VPS37AQ8NEZ2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VPS37AQ8NEZ2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VPS37AQ8NEZ2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VPS37AQ8NEZ2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VPS37AQ8NEZ2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VPS37AQ8NEZ2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VPS37AQ8NEZ2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VPS37AQ8NEZ2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VPS37AQ8NEZ2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VPS37AQ8NEZ2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VPS37AQ8NEZ2 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VPS37AQ8NEZ2 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VPS37AQ8NEZ2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VPS37AQ8NEZ2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VPS37AQ8NEZ2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VPS37AQ8NEZ2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VPS37AQ8NEZ2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
VPS37AQ8NEZ2 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VPS37AQ8NEZ2 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VPS37AQ8NEZ2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VPS37AQ8NEZ2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VPS37AQ8NEZ2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VPS37AQ8NEZ2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VPS37AQ8NEZ2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VPS37AQ8NEZ2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VPS37AQ8NEZ2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
VPS37AQ8NEZ2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VPS37AQ8NEZ2 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VPS37AQ8NEZ2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VPS37AQ8NEZ2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VPS37AQ8NEZ2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VPS37AQ8NEZ2 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VPS37AQ8NEZ2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VPS37AQ8NEZ2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VPS37AQ8NEZ2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VPS37AQ8NEZ2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VPS37AQ8NEZ2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
VPS37AQ8NEZ2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VPS37AQ8NEZ2 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VPS37AQ8NEZ2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VPS37AQ8NEZ2 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VPS37AQ8NEZ2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms