Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEB9

PIK3C3, Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3Q8NEB9 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PIK3C3Q8NEB9 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PIK3C3Q8NEB9 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PIK3C3Q8NEB9 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PIK3C3Q8NEB9 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PIK3C3Q8NEB9 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PIK3C3Q8NEB9 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PIK3C3Q8NEB9 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PIK3C3Q8NEB9 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PIK3C3Q8NEB9 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PIK3C3Q8NEB9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PIK3C3Q8NEB9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PIK3C3Q8NEB9 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
PIK3C3Q8NEB9 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PIK3C3Q8NEB9 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PIK3C3Q8NEB9 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PIK3C3Q8NEB9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PIK3C3Q8NEB9 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PIK3C3Q8NEB9 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PIK3C3Q8NEB9 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PIK3C3Q8NEB9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PIK3C3Q8NEB9 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PIK3C3Q8NEB9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PIK3C3Q8NEB9 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PIK3C3Q8NEB9 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PIK3C3Q8NEB9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PIK3C3Q8NEB9 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PIK3C3Q8NEB9 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PIK3C3Q8NEB9 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PIK3C3Q8NEB9 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PIK3C3Q8NEB9 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PIK3C3Q8NEB9 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PIK3C3Q8NEB9 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PIK3C3Q8NEB9 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PIK3C3Q8NEB9 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PIK3C3Q8NEB9 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PIK3C3Q8NEB9 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PIK3C3Q8NEB9 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PIK3C3Q8NEB9 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PIK3C3Q8NEB9 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PIK3C3Q8NEB9 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PIK3C3Q8NEB9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PIK3C3Q8NEB9 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PIK3C3Q8NEB9 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PIK3C3Q8NEB9 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PIK3C3Q8NEB9 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PIK3C3Q8NEB9 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PIK3C3Q8NEB9 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PIK3C3Q8NEB9 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PIK3C3Q8NEB9 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PIK3C3Q8NEB9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PIK3C3Q8NEB9 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PIK3C3Q8NEB9 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PIK3C3Q8NEB9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PIK3C3Q8NEB9 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PIK3C3Q8NEB9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PIK3C3Q8NEB9 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PIK3C3Q8NEB9 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PIK3C3Q8NEB9 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PIK3C3Q8NEB9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PIK3C3Q8NEB9 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PIK3C3Q8NEB9 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PIK3C3Q8NEB9 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PIK3C3Q8NEB9 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PIK3C3Q8NEB9 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PIK3C3Q8NEB9 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PIK3C3Q8NEB9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PIK3C3Q8NEB9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PIK3C3Q8NEB9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PIK3C3Q8NEB9 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PIK3C3Q8NEB9 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PIK3C3Q8NEB9 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PIK3C3Q8NEB9 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PIK3C3Q8NEB9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PIK3C3Q8NEB9 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PIK3C3Q8NEB9 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PIK3C3Q8NEB9 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PIK3C3Q8NEB9 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PIK3C3Q8NEB9 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PIK3C3Q8NEB9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PIK3C3Q8NEB9 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PIK3C3Q8NEB9 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PIK3C3Q8NEB9 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PIK3C3Q8NEB9 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PIK3C3Q8NEB9 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PIK3C3Q8NEB9 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PIK3C3Q8NEB9 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PIK3C3Q8NEB9 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PIK3C3Q8NEB9 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PIK3C3Q8NEB9 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PIK3C3Q8NEB9 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PIK3C3Q8NEB9 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PIK3C3Q8NEB9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PIK3C3Q8NEB9 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PIK3C3Q8NEB9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PIK3C3Q8NEB9 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PIK3C3Q8NEB9 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PIK3C3Q8NEB9 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PIK3C3Q8NEB9 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PIK3C3Q8NEB9 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms