Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU1

CCDC197, Putative uncharacterized protein CCDC197, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC197Q8NCU1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC197Q8NCU1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC197Q8NCU1 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC197Q8NCU1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC197Q8NCU1 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC197Q8NCU1 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC197Q8NCU1 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC197Q8NCU1 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC197Q8NCU1 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC197Q8NCU1 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC197Q8NCU1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC197Q8NCU1 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC197Q8NCU1 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC197Q8NCU1 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC197Q8NCU1 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC197Q8NCU1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC197Q8NCU1 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC197Q8NCU1 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC197Q8NCU1 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC197Q8NCU1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC197Q8NCU1 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC197Q8NCU1 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC197Q8NCU1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC197Q8NCU1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC197Q8NCU1 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC197Q8NCU1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC197Q8NCU1 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC197Q8NCU1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC197Q8NCU1 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC197Q8NCU1 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC197Q8NCU1 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC197Q8NCU1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC197Q8NCU1 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC197Q8NCU1 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC197Q8NCU1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC197Q8NCU1 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC197Q8NCU1 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC197Q8NCU1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC197Q8NCU1 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC197Q8NCU1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC197Q8NCU1 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC197Q8NCU1 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC197Q8NCU1 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC197Q8NCU1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC197Q8NCU1 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC197Q8NCU1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC197Q8NCU1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC197Q8NCU1 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC197Q8NCU1 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC197Q8NCU1 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC197Q8NCU1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC197Q8NCU1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC197Q8NCU1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC197Q8NCU1 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC197Q8NCU1 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC197Q8NCU1 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC197Q8NCU1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC197Q8NCU1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC197Q8NCU1 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC197Q8NCU1 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC197Q8NCU1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC197Q8NCU1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC197Q8NCU1 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC197Q8NCU1 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC197Q8NCU1 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC197Q8NCU1 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC197Q8NCU1 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC197Q8NCU1 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC197Q8NCU1 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC197Q8NCU1 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC197Q8NCU1 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC197Q8NCU1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC197Q8NCU1 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC197Q8NCU1 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC197Q8NCU1 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC197Q8NCU1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC197Q8NCU1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC197Q8NCU1 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC197Q8NCU1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC197Q8NCU1 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC197Q8NCU1 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC197Q8NCU1 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC197Q8NCU1 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC197Q8NCU1 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC197Q8NCU1 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC197Q8NCU1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC197Q8NCU1 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC197Q8NCU1 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC197Q8NCU1 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC197Q8NCU1 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC197Q8NCU1 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC197Q8NCU1 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC197Q8NCU1 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC197Q8NCU1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC197Q8NCU1 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC197Q8NCU1 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC197Q8NCU1 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC197Q8NCU1 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC197Q8NCU1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC197Q8NCU1 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms