Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBD8

TMEM229B, Transmembrane protein 229B, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM229BQ8NBD8 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMEM229BQ8NBD8 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMEM229BQ8NBD8 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMEM229BQ8NBD8 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMEM229BQ8NBD8 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMEM229BQ8NBD8 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMEM229BQ8NBD8 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMEM229BQ8NBD8 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMEM229BQ8NBD8 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMEM229BQ8NBD8 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMEM229BQ8NBD8 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMEM229BQ8NBD8 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMEM229BQ8NBD8 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
TMEM229BQ8NBD8 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMEM229BQ8NBD8 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
TMEM229BQ8NBD8 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMEM229BQ8NBD8 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
TMEM229BQ8NBD8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMEM229BQ8NBD8 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMEM229BQ8NBD8 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMEM229BQ8NBD8 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMEM229BQ8NBD8 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMEM229BQ8NBD8 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMEM229BQ8NBD8 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMEM229BQ8NBD8 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
TMEM229BQ8NBD8 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
TMEM229BQ8NBD8 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMEM229BQ8NBD8 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMEM229BQ8NBD8 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
TMEM229BQ8NBD8 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMEM229BQ8NBD8 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMEM229BQ8NBD8 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMEM229BQ8NBD8 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMEM229BQ8NBD8 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMEM229BQ8NBD8 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMEM229BQ8NBD8 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMEM229BQ8NBD8 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMEM229BQ8NBD8 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMEM229BQ8NBD8 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMEM229BQ8NBD8 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMEM229BQ8NBD8 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMEM229BQ8NBD8 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMEM229BQ8NBD8 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMEM229BQ8NBD8 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMEM229BQ8NBD8 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMEM229BQ8NBD8 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMEM229BQ8NBD8 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMEM229BQ8NBD8 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMEM229BQ8NBD8 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
TMEM229BQ8NBD8 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
TMEM229BQ8NBD8 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMEM229BQ8NBD8 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMEM229BQ8NBD8 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMEM229BQ8NBD8 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMEM229BQ8NBD8 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMEM229BQ8NBD8 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMEM229BQ8NBD8 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMEM229BQ8NBD8 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMEM229BQ8NBD8 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMEM229BQ8NBD8 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMEM229BQ8NBD8 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMEM229BQ8NBD8 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMEM229BQ8NBD8 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMEM229BQ8NBD8 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMEM229BQ8NBD8 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMEM229BQ8NBD8 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMEM229BQ8NBD8 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMEM229BQ8NBD8 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMEM229BQ8NBD8 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMEM229BQ8NBD8 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMEM229BQ8NBD8 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMEM229BQ8NBD8 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMEM229BQ8NBD8 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMEM229BQ8NBD8 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMEM229BQ8NBD8 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMEM229BQ8NBD8 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMEM229BQ8NBD8 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMEM229BQ8NBD8 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMEM229BQ8NBD8 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMEM229BQ8NBD8 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMEM229BQ8NBD8 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMEM229BQ8NBD8 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMEM229BQ8NBD8 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMEM229BQ8NBD8 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TMEM229BQ8NBD8 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TMEM229BQ8NBD8 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TMEM229BQ8NBD8 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
TMEM229BQ8NBD8 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TMEM229BQ8NBD8 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
TMEM229BQ8NBD8 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TMEM229BQ8NBD8 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
TMEM229BQ8NBD8 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TMEM229BQ8NBD8 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TMEM229BQ8NBD8 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TMEM229BQ8NBD8 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TMEM229BQ8NBD8 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TMEM229BQ8NBD8 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TMEM229BQ8NBD8 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TMEM229BQ8NBD8 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TMEM229BQ8NBD8 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms