Protein–RNA interactions for Protein: Q8NB78

KDM1B, Lysine-specific histone demethylase 1B, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM1BQ8NB78 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KDM1BQ8NB78 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KDM1BQ8NB78 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KDM1BQ8NB78 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KDM1BQ8NB78 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KDM1BQ8NB78 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KDM1BQ8NB78 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KDM1BQ8NB78 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KDM1BQ8NB78 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KDM1BQ8NB78 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KDM1BQ8NB78 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KDM1BQ8NB78 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KDM1BQ8NB78 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KDM1BQ8NB78 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KDM1BQ8NB78 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KDM1BQ8NB78 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KDM1BQ8NB78 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KDM1BQ8NB78 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KDM1BQ8NB78 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KDM1BQ8NB78 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KDM1BQ8NB78 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KDM1BQ8NB78 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
KDM1BQ8NB78 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
KDM1BQ8NB78 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KDM1BQ8NB78 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KDM1BQ8NB78 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KDM1BQ8NB78 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
KDM1BQ8NB78 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KDM1BQ8NB78 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KDM1BQ8NB78 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KDM1BQ8NB78 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KDM1BQ8NB78 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KDM1BQ8NB78 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KDM1BQ8NB78 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KDM1BQ8NB78 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
KDM1BQ8NB78 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KDM1BQ8NB78 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KDM1BQ8NB78 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KDM1BQ8NB78 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KDM1BQ8NB78 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KDM1BQ8NB78 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KDM1BQ8NB78 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KDM1BQ8NB78 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KDM1BQ8NB78 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KDM1BQ8NB78 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
KDM1BQ8NB78 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KDM1BQ8NB78 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KDM1BQ8NB78 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KDM1BQ8NB78 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KDM1BQ8NB78 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KDM1BQ8NB78 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KDM1BQ8NB78 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KDM1BQ8NB78 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KDM1BQ8NB78 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KDM1BQ8NB78 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KDM1BQ8NB78 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KDM1BQ8NB78 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KDM1BQ8NB78 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KDM1BQ8NB78 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
KDM1BQ8NB78 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KDM1BQ8NB78 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KDM1BQ8NB78 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KDM1BQ8NB78 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KDM1BQ8NB78 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KDM1BQ8NB78 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KDM1BQ8NB78 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KDM1BQ8NB78 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KDM1BQ8NB78 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KDM1BQ8NB78 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KDM1BQ8NB78 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
KDM1BQ8NB78 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KDM1BQ8NB78 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KDM1BQ8NB78 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
KDM1BQ8NB78 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KDM1BQ8NB78 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KDM1BQ8NB78 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KDM1BQ8NB78 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
KDM1BQ8NB78 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KDM1BQ8NB78 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KDM1BQ8NB78 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KDM1BQ8NB78 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KDM1BQ8NB78 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
KDM1BQ8NB78 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KDM1BQ8NB78 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KDM1BQ8NB78 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
KDM1BQ8NB78 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KDM1BQ8NB78 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KDM1BQ8NB78 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KDM1BQ8NB78 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KDM1BQ8NB78 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KDM1BQ8NB78 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KDM1BQ8NB78 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KDM1BQ8NB78 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KDM1BQ8NB78 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KDM1BQ8NB78 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KDM1BQ8NB78 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KDM1BQ8NB78 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KDM1BQ8NB78 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KDM1BQ8NB78 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KDM1BQ8NB78 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms