Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA66

CNBD1, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD1Q8NA66 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CNBD1Q8NA66 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CNBD1Q8NA66 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
CNBD1Q8NA66 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CNBD1Q8NA66 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CNBD1Q8NA66 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CNBD1Q8NA66 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
CNBD1Q8NA66 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CNBD1Q8NA66 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CNBD1Q8NA66 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CNBD1Q8NA66 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CNBD1Q8NA66 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CNBD1Q8NA66 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CNBD1Q8NA66 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CNBD1Q8NA66 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CNBD1Q8NA66 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CNBD1Q8NA66 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CNBD1Q8NA66 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CNBD1Q8NA66 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CNBD1Q8NA66 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
CNBD1Q8NA66 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
CNBD1Q8NA66 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CNBD1Q8NA66 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
CNBD1Q8NA66 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CNBD1Q8NA66 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CNBD1Q8NA66 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CNBD1Q8NA66 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
CNBD1Q8NA66 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CNBD1Q8NA66 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CNBD1Q8NA66 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CNBD1Q8NA66 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CNBD1Q8NA66 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CNBD1Q8NA66 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CNBD1Q8NA66 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CNBD1Q8NA66 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CNBD1Q8NA66 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CNBD1Q8NA66 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CNBD1Q8NA66 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CNBD1Q8NA66 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CNBD1Q8NA66 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CNBD1Q8NA66 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CNBD1Q8NA66 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CNBD1Q8NA66 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CNBD1Q8NA66 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CNBD1Q8NA66 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CNBD1Q8NA66 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CNBD1Q8NA66 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CNBD1Q8NA66 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
CNBD1Q8NA66 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
CNBD1Q8NA66 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CNBD1Q8NA66 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CNBD1Q8NA66 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CNBD1Q8NA66 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CNBD1Q8NA66 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CNBD1Q8NA66 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CNBD1Q8NA66 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CNBD1Q8NA66 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CNBD1Q8NA66 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CNBD1Q8NA66 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CNBD1Q8NA66 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CNBD1Q8NA66 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CNBD1Q8NA66 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CNBD1Q8NA66 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CNBD1Q8NA66 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CNBD1Q8NA66 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
CNBD1Q8NA66 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CNBD1Q8NA66 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CNBD1Q8NA66 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CNBD1Q8NA66 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CNBD1Q8NA66 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CNBD1Q8NA66 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CNBD1Q8NA66 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CNBD1Q8NA66 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CNBD1Q8NA66 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CNBD1Q8NA66 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CNBD1Q8NA66 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CNBD1Q8NA66 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CNBD1Q8NA66 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CNBD1Q8NA66 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CNBD1Q8NA66 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CNBD1Q8NA66 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CNBD1Q8NA66 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CNBD1Q8NA66 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
CNBD1Q8NA66 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CNBD1Q8NA66 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CNBD1Q8NA66 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CNBD1Q8NA66 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CNBD1Q8NA66 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CNBD1Q8NA66 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CNBD1Q8NA66 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
CNBD1Q8NA66 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CNBD1Q8NA66 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CNBD1Q8NA66 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CNBD1Q8NA66 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CNBD1Q8NA66 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CNBD1Q8NA66 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
CNBD1Q8NA66 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CNBD1Q8NA66 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CNBD1Q8NA66 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CNBD1Q8NA66 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms