Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3U4

STAG2, Cohesin subunit SA-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAG2Q8N3U4 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
STAG2Q8N3U4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
STAG2Q8N3U4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
STAG2Q8N3U4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
STAG2Q8N3U4 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
STAG2Q8N3U4 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
STAG2Q8N3U4 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
STAG2Q8N3U4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
STAG2Q8N3U4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
STAG2Q8N3U4 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
STAG2Q8N3U4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
STAG2Q8N3U4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
STAG2Q8N3U4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
STAG2Q8N3U4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
STAG2Q8N3U4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
STAG2Q8N3U4 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
STAG2Q8N3U4 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
STAG2Q8N3U4 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
STAG2Q8N3U4 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
STAG2Q8N3U4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
STAG2Q8N3U4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
STAG2Q8N3U4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
STAG2Q8N3U4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
STAG2Q8N3U4 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
STAG2Q8N3U4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
STAG2Q8N3U4 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
STAG2Q8N3U4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
STAG2Q8N3U4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
STAG2Q8N3U4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
STAG2Q8N3U4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
STAG2Q8N3U4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
STAG2Q8N3U4 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
STAG2Q8N3U4 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
STAG2Q8N3U4 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
STAG2Q8N3U4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
STAG2Q8N3U4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
STAG2Q8N3U4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
STAG2Q8N3U4 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
STAG2Q8N3U4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
STAG2Q8N3U4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
STAG2Q8N3U4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
STAG2Q8N3U4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
STAG2Q8N3U4 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
STAG2Q8N3U4 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
STAG2Q8N3U4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
STAG2Q8N3U4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
STAG2Q8N3U4 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
STAG2Q8N3U4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
STAG2Q8N3U4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
STAG2Q8N3U4 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
STAG2Q8N3U4 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
STAG2Q8N3U4 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
STAG2Q8N3U4 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
STAG2Q8N3U4 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
STAG2Q8N3U4 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
STAG2Q8N3U4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
STAG2Q8N3U4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
STAG2Q8N3U4 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
STAG2Q8N3U4 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
STAG2Q8N3U4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
STAG2Q8N3U4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
STAG2Q8N3U4 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
STAG2Q8N3U4 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
STAG2Q8N3U4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
STAG2Q8N3U4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
STAG2Q8N3U4 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
STAG2Q8N3U4 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
STAG2Q8N3U4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
STAG2Q8N3U4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
STAG2Q8N3U4 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
STAG2Q8N3U4 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
STAG2Q8N3U4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
STAG2Q8N3U4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
STAG2Q8N3U4 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
STAG2Q8N3U4 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
STAG2Q8N3U4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
STAG2Q8N3U4 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
STAG2Q8N3U4 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
STAG2Q8N3U4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
STAG2Q8N3U4 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
STAG2Q8N3U4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
STAG2Q8N3U4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
STAG2Q8N3U4 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
STAG2Q8N3U4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
STAG2Q8N3U4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
STAG2Q8N3U4 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
STAG2Q8N3U4 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
STAG2Q8N3U4 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
STAG2Q8N3U4 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
STAG2Q8N3U4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
STAG2Q8N3U4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
STAG2Q8N3U4 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
STAG2Q8N3U4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
STAG2Q8N3U4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
STAG2Q8N3U4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
STAG2Q8N3U4 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
STAG2Q8N3U4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
STAG2Q8N3U4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
STAG2Q8N3U4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
STAG2Q8N3U4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms