Protein–RNA interactions for Protein: Q8N135

LGI4, Leucine-rich repeat LGI family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGI4Q8N135 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LGI4Q8N135 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LGI4Q8N135 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LGI4Q8N135 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LGI4Q8N135 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
LGI4Q8N135 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LGI4Q8N135 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LGI4Q8N135 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LGI4Q8N135 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LGI4Q8N135 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LGI4Q8N135 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LGI4Q8N135 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LGI4Q8N135 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LGI4Q8N135 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LGI4Q8N135 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LGI4Q8N135 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LGI4Q8N135 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LGI4Q8N135 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LGI4Q8N135 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LGI4Q8N135 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LGI4Q8N135 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LGI4Q8N135 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LGI4Q8N135 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LGI4Q8N135 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LGI4Q8N135 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LGI4Q8N135 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LGI4Q8N135 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LGI4Q8N135 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LGI4Q8N135 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LGI4Q8N135 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LGI4Q8N135 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LGI4Q8N135 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LGI4Q8N135 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LGI4Q8N135 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LGI4Q8N135 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LGI4Q8N135 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LGI4Q8N135 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LGI4Q8N135 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LGI4Q8N135 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LGI4Q8N135 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LGI4Q8N135 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LGI4Q8N135 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LGI4Q8N135 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LGI4Q8N135 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LGI4Q8N135 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LGI4Q8N135 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LGI4Q8N135 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LGI4Q8N135 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LGI4Q8N135 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LGI4Q8N135 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LGI4Q8N135 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LGI4Q8N135 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LGI4Q8N135 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LGI4Q8N135 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LGI4Q8N135 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LGI4Q8N135 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LGI4Q8N135 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LGI4Q8N135 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LGI4Q8N135 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LGI4Q8N135 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
LGI4Q8N135 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
LGI4Q8N135 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LGI4Q8N135 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LGI4Q8N135 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LGI4Q8N135 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LGI4Q8N135 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LGI4Q8N135 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LGI4Q8N135 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LGI4Q8N135 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
LGI4Q8N135 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LGI4Q8N135 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LGI4Q8N135 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
LGI4Q8N135 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LGI4Q8N135 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
LGI4Q8N135 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LGI4Q8N135 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LGI4Q8N135 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LGI4Q8N135 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LGI4Q8N135 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
LGI4Q8N135 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LGI4Q8N135 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LGI4Q8N135 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LGI4Q8N135 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
LGI4Q8N135 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LGI4Q8N135 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LGI4Q8N135 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LGI4Q8N135 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LGI4Q8N135 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LGI4Q8N135 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LGI4Q8N135 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LGI4Q8N135 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LGI4Q8N135 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LGI4Q8N135 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LGI4Q8N135 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LGI4Q8N135 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LGI4Q8N135 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LGI4Q8N135 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LGI4Q8N135 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
LGI4Q8N135 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LGI4Q8N135 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms