Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV01

SYT12, Synaptotagmin-12, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT12Q8IV01 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SYT12Q8IV01 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SYT12Q8IV01 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SYT12Q8IV01 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SYT12Q8IV01 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SYT12Q8IV01 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SYT12Q8IV01 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SYT12Q8IV01 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SYT12Q8IV01 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SYT12Q8IV01 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SYT12Q8IV01 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SYT12Q8IV01 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SYT12Q8IV01 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SYT12Q8IV01 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SYT12Q8IV01 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SYT12Q8IV01 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SYT12Q8IV01 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SYT12Q8IV01 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SYT12Q8IV01 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SYT12Q8IV01 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SYT12Q8IV01 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SYT12Q8IV01 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SYT12Q8IV01 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SYT12Q8IV01 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SYT12Q8IV01 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SYT12Q8IV01 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SYT12Q8IV01 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SYT12Q8IV01 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SYT12Q8IV01 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYT12Q8IV01 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYT12Q8IV01 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYT12Q8IV01 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYT12Q8IV01 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYT12Q8IV01 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYT12Q8IV01 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYT12Q8IV01 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYT12Q8IV01 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYT12Q8IV01 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYT12Q8IV01 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYT12Q8IV01 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYT12Q8IV01 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYT12Q8IV01 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYT12Q8IV01 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYT12Q8IV01 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYT12Q8IV01 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYT12Q8IV01 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYT12Q8IV01 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYT12Q8IV01 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SYT12Q8IV01 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYT12Q8IV01 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYT12Q8IV01 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYT12Q8IV01 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYT12Q8IV01 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYT12Q8IV01 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYT12Q8IV01 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYT12Q8IV01 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYT12Q8IV01 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYT12Q8IV01 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYT12Q8IV01 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYT12Q8IV01 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYT12Q8IV01 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SYT12Q8IV01 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYT12Q8IV01 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYT12Q8IV01 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SYT12Q8IV01 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYT12Q8IV01 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYT12Q8IV01 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYT12Q8IV01 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYT12Q8IV01 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYT12Q8IV01 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYT12Q8IV01 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SYT12Q8IV01 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYT12Q8IV01 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYT12Q8IV01 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYT12Q8IV01 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SYT12Q8IV01 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SYT12Q8IV01 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYT12Q8IV01 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYT12Q8IV01 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYT12Q8IV01 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYT12Q8IV01 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYT12Q8IV01 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SYT12Q8IV01 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SYT12Q8IV01 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYT12Q8IV01 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYT12Q8IV01 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SYT12Q8IV01 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SYT12Q8IV01 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SYT12Q8IV01 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SYT12Q8IV01 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYT12Q8IV01 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYT12Q8IV01 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYT12Q8IV01 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYT12Q8IV01 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYT12Q8IV01 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYT12Q8IV01 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYT12Q8IV01 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYT12Q8IV01 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYT12Q8IV01 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYT12Q8IV01 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms