Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUI4

SNX29P2, Putative protein SNX29P2, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29P2Q8IUI4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SNX29P2Q8IUI4 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SNX29P2Q8IUI4 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SNX29P2Q8IUI4 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SNX29P2Q8IUI4 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SNX29P2Q8IUI4 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SNX29P2Q8IUI4 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SNX29P2Q8IUI4 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SNX29P2Q8IUI4 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SNX29P2Q8IUI4 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
SNX29P2Q8IUI4 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SNX29P2Q8IUI4 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SNX29P2Q8IUI4 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SNX29P2Q8IUI4 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SNX29P2Q8IUI4 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SNX29P2Q8IUI4 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SNX29P2Q8IUI4 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SNX29P2Q8IUI4 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SNX29P2Q8IUI4 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SNX29P2Q8IUI4 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
SNX29P2Q8IUI4 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SNX29P2Q8IUI4 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SNX29P2Q8IUI4 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
SNX29P2Q8IUI4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SNX29P2Q8IUI4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SNX29P2Q8IUI4 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SNX29P2Q8IUI4 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
SNX29P2Q8IUI4 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SNX29P2Q8IUI4 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SNX29P2Q8IUI4 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SNX29P2Q8IUI4 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SNX29P2Q8IUI4 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SNX29P2Q8IUI4 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SNX29P2Q8IUI4 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SNX29P2Q8IUI4 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SNX29P2Q8IUI4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SNX29P2Q8IUI4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SNX29P2Q8IUI4 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SNX29P2Q8IUI4 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SNX29P2Q8IUI4 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SNX29P2Q8IUI4 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SNX29P2Q8IUI4 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SNX29P2Q8IUI4 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
SNX29P2Q8IUI4 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SNX29P2Q8IUI4 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SNX29P2Q8IUI4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SNX29P2Q8IUI4 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SNX29P2Q8IUI4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SNX29P2Q8IUI4 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SNX29P2Q8IUI4 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SNX29P2Q8IUI4 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SNX29P2Q8IUI4 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SNX29P2Q8IUI4 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SNX29P2Q8IUI4 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SNX29P2Q8IUI4 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SNX29P2Q8IUI4 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SNX29P2Q8IUI4 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SNX29P2Q8IUI4 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SNX29P2Q8IUI4 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SNX29P2Q8IUI4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SNX29P2Q8IUI4 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SNX29P2Q8IUI4 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SNX29P2Q8IUI4 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SNX29P2Q8IUI4 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SNX29P2Q8IUI4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SNX29P2Q8IUI4 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SNX29P2Q8IUI4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SNX29P2Q8IUI4 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SNX29P2Q8IUI4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SNX29P2Q8IUI4 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SNX29P2Q8IUI4 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SNX29P2Q8IUI4 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SNX29P2Q8IUI4 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SNX29P2Q8IUI4 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SNX29P2Q8IUI4 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SNX29P2Q8IUI4 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SNX29P2Q8IUI4 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SNX29P2Q8IUI4 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SNX29P2Q8IUI4 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SNX29P2Q8IUI4 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNX29P2Q8IUI4 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNX29P2Q8IUI4 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNX29P2Q8IUI4 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNX29P2Q8IUI4 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNX29P2Q8IUI4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
SNX29P2Q8IUI4 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNX29P2Q8IUI4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNX29P2Q8IUI4 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNX29P2Q8IUI4 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNX29P2Q8IUI4 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNX29P2Q8IUI4 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNX29P2Q8IUI4 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNX29P2Q8IUI4 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNX29P2Q8IUI4 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNX29P2Q8IUI4 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNX29P2Q8IUI4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNX29P2Q8IUI4 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNX29P2Q8IUI4 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNX29P2Q8IUI4 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNX29P2Q8IUI4 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms