Protein–RNA interactions for Protein: Q86WH2

RASSF3, Ras association domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASSF3Q86WH2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RASSF3Q86WH2 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RASSF3Q86WH2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RASSF3Q86WH2 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RASSF3Q86WH2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RASSF3Q86WH2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RASSF3Q86WH2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RASSF3Q86WH2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RASSF3Q86WH2 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RASSF3Q86WH2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RASSF3Q86WH2 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RASSF3Q86WH2 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RASSF3Q86WH2 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RASSF3Q86WH2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RASSF3Q86WH2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RASSF3Q86WH2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RASSF3Q86WH2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RASSF3Q86WH2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RASSF3Q86WH2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RASSF3Q86WH2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RASSF3Q86WH2 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RASSF3Q86WH2 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
RASSF3Q86WH2 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RASSF3Q86WH2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RASSF3Q86WH2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RASSF3Q86WH2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RASSF3Q86WH2 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RASSF3Q86WH2 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RASSF3Q86WH2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RASSF3Q86WH2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
RASSF3Q86WH2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RASSF3Q86WH2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RASSF3Q86WH2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RASSF3Q86WH2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RASSF3Q86WH2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RASSF3Q86WH2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RASSF3Q86WH2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RASSF3Q86WH2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RASSF3Q86WH2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RASSF3Q86WH2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RASSF3Q86WH2 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RASSF3Q86WH2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RASSF3Q86WH2 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RASSF3Q86WH2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RASSF3Q86WH2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RASSF3Q86WH2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RASSF3Q86WH2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RASSF3Q86WH2 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RASSF3Q86WH2 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RASSF3Q86WH2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RASSF3Q86WH2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RASSF3Q86WH2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RASSF3Q86WH2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RASSF3Q86WH2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RASSF3Q86WH2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RASSF3Q86WH2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RASSF3Q86WH2 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RASSF3Q86WH2 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RASSF3Q86WH2 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RASSF3Q86WH2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RASSF3Q86WH2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RASSF3Q86WH2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RASSF3Q86WH2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RASSF3Q86WH2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
RASSF3Q86WH2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RASSF3Q86WH2 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RASSF3Q86WH2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RASSF3Q86WH2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RASSF3Q86WH2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RASSF3Q86WH2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RASSF3Q86WH2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RASSF3Q86WH2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RASSF3Q86WH2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RASSF3Q86WH2 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RASSF3Q86WH2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RASSF3Q86WH2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RASSF3Q86WH2 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RASSF3Q86WH2 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RASSF3Q86WH2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RASSF3Q86WH2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RASSF3Q86WH2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RASSF3Q86WH2 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RASSF3Q86WH2 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RASSF3Q86WH2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RASSF3Q86WH2 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RASSF3Q86WH2 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RASSF3Q86WH2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RASSF3Q86WH2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RASSF3Q86WH2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RASSF3Q86WH2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RASSF3Q86WH2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RASSF3Q86WH2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RASSF3Q86WH2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RASSF3Q86WH2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RASSF3Q86WH2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
RASSF3Q86WH2 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RASSF3Q86WH2 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RASSF3Q86WH2 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
RASSF3Q86WH2 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RASSF3Q86WH2 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms