Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT5

PDZD3, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF4, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZD3Q86UT5 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDZD3Q86UT5 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDZD3Q86UT5 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PDZD3Q86UT5 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PDZD3Q86UT5 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDZD3Q86UT5 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDZD3Q86UT5 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDZD3Q86UT5 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDZD3Q86UT5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDZD3Q86UT5 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDZD3Q86UT5 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDZD3Q86UT5 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDZD3Q86UT5 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDZD3Q86UT5 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDZD3Q86UT5 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDZD3Q86UT5 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDZD3Q86UT5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDZD3Q86UT5 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDZD3Q86UT5 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDZD3Q86UT5 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDZD3Q86UT5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDZD3Q86UT5 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDZD3Q86UT5 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PDZD3Q86UT5 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDZD3Q86UT5 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDZD3Q86UT5 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDZD3Q86UT5 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDZD3Q86UT5 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDZD3Q86UT5 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDZD3Q86UT5 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDZD3Q86UT5 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDZD3Q86UT5 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDZD3Q86UT5 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDZD3Q86UT5 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PDZD3Q86UT5 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDZD3Q86UT5 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDZD3Q86UT5 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDZD3Q86UT5 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDZD3Q86UT5 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDZD3Q86UT5 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDZD3Q86UT5 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDZD3Q86UT5 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDZD3Q86UT5 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDZD3Q86UT5 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDZD3Q86UT5 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDZD3Q86UT5 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDZD3Q86UT5 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDZD3Q86UT5 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDZD3Q86UT5 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDZD3Q86UT5 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDZD3Q86UT5 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDZD3Q86UT5 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDZD3Q86UT5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDZD3Q86UT5 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDZD3Q86UT5 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDZD3Q86UT5 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDZD3Q86UT5 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDZD3Q86UT5 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDZD3Q86UT5 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDZD3Q86UT5 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDZD3Q86UT5 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDZD3Q86UT5 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDZD3Q86UT5 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDZD3Q86UT5 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDZD3Q86UT5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDZD3Q86UT5 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDZD3Q86UT5 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDZD3Q86UT5 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDZD3Q86UT5 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDZD3Q86UT5 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDZD3Q86UT5 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDZD3Q86UT5 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PDZD3Q86UT5 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDZD3Q86UT5 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDZD3Q86UT5 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDZD3Q86UT5 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDZD3Q86UT5 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDZD3Q86UT5 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDZD3Q86UT5 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDZD3Q86UT5 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDZD3Q86UT5 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDZD3Q86UT5 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDZD3Q86UT5 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDZD3Q86UT5 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDZD3Q86UT5 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDZD3Q86UT5 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDZD3Q86UT5 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDZD3Q86UT5 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDZD3Q86UT5 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDZD3Q86UT5 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDZD3Q86UT5 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDZD3Q86UT5 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PDZD3Q86UT5 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDZD3Q86UT5 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDZD3Q86UT5 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDZD3Q86UT5 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDZD3Q86UT5 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDZD3Q86UT5 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDZD3Q86UT5 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDZD3Q86UT5 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms