Protein–RNA interactions for Protein: Q86SE8

NPM2, Nucleoplasmin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPM2Q86SE8 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
NPM2Q86SE8 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
NPM2Q86SE8 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
NPM2Q86SE8 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
NPM2Q86SE8 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
NPM2Q86SE8 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
NPM2Q86SE8 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
NPM2Q86SE8 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
NPM2Q86SE8 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
NPM2Q86SE8 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
NPM2Q86SE8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
NPM2Q86SE8 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
NPM2Q86SE8 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
NPM2Q86SE8 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
NPM2Q86SE8 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
NPM2Q86SE8 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
NPM2Q86SE8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
NPM2Q86SE8 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
NPM2Q86SE8 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
NPM2Q86SE8 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.53
NPM2Q86SE8 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
NPM2Q86SE8 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
NPM2Q86SE8 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
NPM2Q86SE8 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
NPM2Q86SE8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
NPM2Q86SE8 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
NPM2Q86SE8 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
NPM2Q86SE8 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
NPM2Q86SE8 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
NPM2Q86SE8 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
NPM2Q86SE8 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
NPM2Q86SE8 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
NPM2Q86SE8 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
NPM2Q86SE8 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
NPM2Q86SE8 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC30.86■■■□□ 2.53
NPM2Q86SE8 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
NPM2Q86SE8 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
NPM2Q86SE8 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
NPM2Q86SE8 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
NPM2Q86SE8 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
NPM2Q86SE8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
NPM2Q86SE8 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
NPM2Q86SE8 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
NPM2Q86SE8 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
NPM2Q86SE8 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC30.84■■■□□ 2.53
NPM2Q86SE8 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
NPM2Q86SE8 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
NPM2Q86SE8 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
NPM2Q86SE8 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
NPM2Q86SE8 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
NPM2Q86SE8 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
NPM2Q86SE8 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
NPM2Q86SE8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
NPM2Q86SE8 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
NPM2Q86SE8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.53
NPM2Q86SE8 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
NPM2Q86SE8 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
NPM2Q86SE8 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
NPM2Q86SE8 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
NPM2Q86SE8 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
NPM2Q86SE8 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
NPM2Q86SE8 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
NPM2Q86SE8 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
NPM2Q86SE8 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
NPM2Q86SE8 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
NPM2Q86SE8 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
NPM2Q86SE8 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
NPM2Q86SE8 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
NPM2Q86SE8 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
NPM2Q86SE8 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
NPM2Q86SE8 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
NPM2Q86SE8 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
NPM2Q86SE8 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
NPM2Q86SE8 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
NPM2Q86SE8 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
NPM2Q86SE8 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
NPM2Q86SE8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
NPM2Q86SE8 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
NPM2Q86SE8 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
NPM2Q86SE8 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
NPM2Q86SE8 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
NPM2Q86SE8 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
NPM2Q86SE8 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
NPM2Q86SE8 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
NPM2Q86SE8 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
NPM2Q86SE8 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
NPM2Q86SE8 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
NPM2Q86SE8 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
NPM2Q86SE8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
NPM2Q86SE8 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
NPM2Q86SE8 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
NPM2Q86SE8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
NPM2Q86SE8 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
NPM2Q86SE8 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
NPM2Q86SE8 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
NPM2Q86SE8 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
NPM2Q86SE8 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
NPM2Q86SE8 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
NPM2Q86SE8 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
NPM2Q86SE8 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms