Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z404

TMC4, Transmembrane channel-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC4Q7Z404 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TMC4Q7Z404 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TMC4Q7Z404 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TMC4Q7Z404 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TMC4Q7Z404 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TMC4Q7Z404 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TMC4Q7Z404 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TMC4Q7Z404 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TMC4Q7Z404 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TMC4Q7Z404 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TMC4Q7Z404 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TMC4Q7Z404 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TMC4Q7Z404 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TMC4Q7Z404 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
TMC4Q7Z404 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
TMC4Q7Z404 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
TMC4Q7Z404 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TMC4Q7Z404 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TMC4Q7Z404 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TMC4Q7Z404 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TMC4Q7Z404 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TMC4Q7Z404 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TMC4Q7Z404 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TMC4Q7Z404 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
TMC4Q7Z404 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TMC4Q7Z404 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TMC4Q7Z404 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TMC4Q7Z404 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TMC4Q7Z404 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TMC4Q7Z404 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TMC4Q7Z404 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TMC4Q7Z404 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TMC4Q7Z404 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TMC4Q7Z404 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TMC4Q7Z404 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TMC4Q7Z404 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TMC4Q7Z404 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TMC4Q7Z404 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TMC4Q7Z404 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TMC4Q7Z404 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TMC4Q7Z404 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TMC4Q7Z404 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TMC4Q7Z404 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TMC4Q7Z404 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TMC4Q7Z404 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
TMC4Q7Z404 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TMC4Q7Z404 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TMC4Q7Z404 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
TMC4Q7Z404 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
TMC4Q7Z404 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TMC4Q7Z404 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TMC4Q7Z404 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TMC4Q7Z404 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
TMC4Q7Z404 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TMC4Q7Z404 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TMC4Q7Z404 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
TMC4Q7Z404 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
TMC4Q7Z404 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TMC4Q7Z404 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TMC4Q7Z404 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TMC4Q7Z404 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TMC4Q7Z404 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TMC4Q7Z404 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TMC4Q7Z404 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TMC4Q7Z404 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TMC4Q7Z404 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TMC4Q7Z404 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TMC4Q7Z404 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TMC4Q7Z404 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
TMC4Q7Z404 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TMC4Q7Z404 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TMC4Q7Z404 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TMC4Q7Z404 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TMC4Q7Z404 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TMC4Q7Z404 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TMC4Q7Z404 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TMC4Q7Z404 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TMC4Q7Z404 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TMC4Q7Z404 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TMC4Q7Z404 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TMC4Q7Z404 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TMC4Q7Z404 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TMC4Q7Z404 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TMC4Q7Z404 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TMC4Q7Z404 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TMC4Q7Z404 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
TMC4Q7Z404 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TMC4Q7Z404 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TMC4Q7Z404 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TMC4Q7Z404 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TMC4Q7Z404 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TMC4Q7Z404 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TMC4Q7Z404 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TMC4Q7Z404 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TMC4Q7Z404 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TMC4Q7Z404 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TMC4Q7Z404 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TMC4Q7Z404 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
TMC4Q7Z404 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TMC4Q7Z404 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms