Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT9

SLC29A4, Equilibrative nucleoside transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC29A4Q7RTT9 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC29A4Q7RTT9 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC29A4Q7RTT9 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC29A4Q7RTT9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC29A4Q7RTT9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC29A4Q7RTT9 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC29A4Q7RTT9 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC29A4Q7RTT9 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC29A4Q7RTT9 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC29A4Q7RTT9 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC29A4Q7RTT9 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC29A4Q7RTT9 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC29A4Q7RTT9 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC29A4Q7RTT9 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC29A4Q7RTT9 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC29A4Q7RTT9 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC29A4Q7RTT9 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC29A4Q7RTT9 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC29A4Q7RTT9 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC29A4Q7RTT9 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC29A4Q7RTT9 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC29A4Q7RTT9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC29A4Q7RTT9 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC29A4Q7RTT9 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC29A4Q7RTT9 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC29A4Q7RTT9 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC29A4Q7RTT9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC29A4Q7RTT9 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC29A4Q7RTT9 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC29A4Q7RTT9 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC29A4Q7RTT9 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC29A4Q7RTT9 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC29A4Q7RTT9 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SLC29A4Q7RTT9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SLC29A4Q7RTT9 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SLC29A4Q7RTT9 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC29A4Q7RTT9 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC29A4Q7RTT9 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC29A4Q7RTT9 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC29A4Q7RTT9 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC29A4Q7RTT9 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC29A4Q7RTT9 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC29A4Q7RTT9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC29A4Q7RTT9 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC29A4Q7RTT9 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC29A4Q7RTT9 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC29A4Q7RTT9 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC29A4Q7RTT9 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC29A4Q7RTT9 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC29A4Q7RTT9 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC29A4Q7RTT9 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC29A4Q7RTT9 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC29A4Q7RTT9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC29A4Q7RTT9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC29A4Q7RTT9 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC29A4Q7RTT9 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC29A4Q7RTT9 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC29A4Q7RTT9 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC29A4Q7RTT9 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC29A4Q7RTT9 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC29A4Q7RTT9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC29A4Q7RTT9 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC29A4Q7RTT9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC29A4Q7RTT9 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC29A4Q7RTT9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC29A4Q7RTT9 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC29A4Q7RTT9 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC29A4Q7RTT9 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC29A4Q7RTT9 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC29A4Q7RTT9 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC29A4Q7RTT9 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC29A4Q7RTT9 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC29A4Q7RTT9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC29A4Q7RTT9 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC29A4Q7RTT9 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC29A4Q7RTT9 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC29A4Q7RTT9 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC29A4Q7RTT9 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC29A4Q7RTT9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC29A4Q7RTT9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC29A4Q7RTT9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC29A4Q7RTT9 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC29A4Q7RTT9 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC29A4Q7RTT9 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC29A4Q7RTT9 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC29A4Q7RTT9 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC29A4Q7RTT9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC29A4Q7RTT9 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC29A4Q7RTT9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC29A4Q7RTT9 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC29A4Q7RTT9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC29A4Q7RTT9 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC29A4Q7RTT9 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC29A4Q7RTT9 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC29A4Q7RTT9 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC29A4Q7RTT9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC29A4Q7RTT9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC29A4Q7RTT9 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC29A4Q7RTT9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC29A4Q7RTT9 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms