Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC2

LARP4, La-related protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 724 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP4Q71RC2 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.093e-12■■■■■ 29.1
LARP4Q71RC2 PSMD3-204ENST00000540504 458 ntTSL 315.19■□□□□ 0.023e-12■■■■■ 29.1
LARP4Q71RC2 PLEKHA8P1-204ENST00000550498 487 ntTSL 314.13□□□□□ -0.153e-12■■■■■ 29.1
LARP4Q71RC2 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.243e-8■■■■■ 29.1
LARP4Q71RC2 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.373e-12■■■■■ 29.1
LARP4Q71RC2 POMP-202ENST00000460403 1428 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.473e-8■■■■■ 29.1
LARP4Q71RC2 AC141557.1-201ENST00000540982 400 ntBASIC1.79□□□□□ -2.122e-7■■■■■ 29.1
LARP4Q71RC2 AC091987.1-202ENST00000522464 789 ntTSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.161e-6■■■■■ 29.1
LARP4Q71RC2 XIST-202ENST00000417942 724 ntTSL 36.1□□□□□ -1.432e-14■■■■■ 29
LARP4Q71RC2 XIST-201ENST00000416330 750 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.52e-14■■■■■ 29
LARP4Q71RC2 XIST-203ENST00000421322 446 ntTSL 24.08□□□□□ -1.762e-14■■■■■ 29
LARP4Q71RC2 PEPD-211ENST00000593085 1763 ntTSL 219.92■□□□□ 0.781e-8■■■■■ 29
LARP4Q71RC2 PEPD-210ENST00000591968 943 ntTSL 213.89□□□□□ -0.191e-8■■■■■ 29
LARP4Q71RC2 PEPD-206ENST00000589598 596 ntTSL 38.78□□□□□ -11e-8■■■■■ 29
LARP4Q71RC2 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.92e-9■■■■■ 29
LARP4Q71RC2 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.425e-15■■■■■ 29
LARP4Q71RC2 MAGOH-204ENST00000495868 695 ntTSL 1 (best)8.91□□□□□ -0.985e-15■■■■■ 29
LARP4Q71RC2 MAGOH-201ENST00000371466 500 ntTSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.155e-15■■■■■ 29
LARP4Q71RC2 FBXL13-211ENST00000477915 743 ntTSL 56.45□□□□□ -1.381e-6■■■■■ 28.9
LARP4Q71RC2 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.018e-7■■■■■ 28.9
LARP4Q71RC2 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.298e-7■■■■■ 28.9
LARP4Q71RC2 MRPS12-202ENST00000402029 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.398e-7■■■■■ 28.9
LARP4Q71RC2 MGC4859-201ENST00000634803 3118 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.472e-6■■■■■ 28.9
LARP4Q71RC2 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.32e-6■■■■■ 28.8
LARP4Q71RC2 LCORL-205ENST00000510451 1013 ntTSL 212.54□□□□□ -0.42e-6■■■■■ 28.8
LARP4Q71RC2 LCORL-207ENST00000635767 10430 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.842e-6■■■■■ 28.8
LARP4Q71RC2 LCORL-208ENST00000637787 9431 ntTSL 54.32□□□□□ -1.722e-6■■■■■ 28.8
LARP4Q71RC2 CMC2-222ENST00000570086 801 ntTSL 315.05■□□□□ -01e-6■■■■■ 28.8
LARP4Q71RC2 CMC2-220ENST00000569187 612 ntTSL 213.46□□□□□ -0.251e-6■■■■■ 28.8
LARP4Q71RC2 CMC2-202ENST00000486645 766 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.51e-6■■■■■ 28.8
LARP4Q71RC2 CMC2-201ENST00000219400 10301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.621e-6■■■■■ 28.8
LARP4Q71RC2 CMC2-223ENST00000570195 871 ntTSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.821e-6■■■■■ 28.8
LARP4Q71RC2 CMC2-208ENST00000564249 890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.331e-6■■■■■ 28.8
LARP4Q71RC2 CMC2-206ENST00000563779 2087 ntTSL 1 (best)6.64□□□□□ -1.351e-6■■■■■ 28.8
LARP4Q71RC2 CMC2-217ENST00000566918 605 ntTSL 36.49□□□□□ -1.371e-6■■■■■ 28.8
LARP4Q71RC2 CMC2-203ENST00000561614 683 ntTSL 35.31□□□□□ -1.561e-6■■■■■ 28.8
LARP4Q71RC2 CMC2-215ENST00000566047 660 ntTSL 24.93□□□□□ -1.621e-6■■■■■ 28.8
LARP4Q71RC2 CMC2-216ENST00000566231 652 ntTSL 34.93□□□□□ -1.621e-6■■■■■ 28.8
LARP4Q71RC2 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.142e-16■■■■■ 28.8
LARP4Q71RC2 ERP29-202ENST00000455836 1333 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.472e-16■■■■■ 28.8
LARP4Q71RC2 ERP29-201ENST00000261735 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.542e-16■■■■■ 28.8
LARP4Q71RC2 CORO7-PAM16-203ENST00000575334 3815 ntTSL 217.22■□□□□ 0.353e-6■■■■■ 28.8
LARP4Q71RC2 PAM16-210ENST00000575636 732 ntTSL 316.37■□□□□ 0.213e-6■■■■■ 28.8
LARP4Q71RC2 PAM16-205ENST00000571986 606 ntTSL 315.93■□□□□ 0.143e-6■■■■■ 28.8
LARP4Q71RC2 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.143e-6■■■■■ 28.8
LARP4Q71RC2 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.063e-6■■■■■ 28.8
LARP4Q71RC2 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.043e-6■■■■■ 28.8
LARP4Q71RC2 CORO7-PAM16-201ENST00000572274 672 ntTSL 514.68□□□□□ -0.063e-6■■■■■ 28.8
LARP4Q71RC2 PAM16-209ENST00000573614 650 ntTSL 514.36□□□□□ -0.113e-6■■■■■ 28.8
LARP4Q71RC2 PAM16-206ENST00000573236 704 ntTSL 1 (best)14.16□□□□□ -0.143e-6■■■■■ 28.8
LARP4Q71RC2 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.143e-6■■■■■ 28.8
LARP4Q71RC2 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.193e-6■■■■■ 28.8
LARP4Q71RC2 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.193e-6■■■■■ 28.8
LARP4Q71RC2 PAM16-202ENST00000571178 353 ntTSL 313.24□□□□□ -0.293e-6■■■■■ 28.8
LARP4Q71RC2 CORO7-PAM16-202ENST00000572467 3284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.363e-6■■■■■ 28.8
LARP4Q71RC2 PAM16-207ENST00000573450 579 ntTSL 211.06□□□□□ -0.643e-6■■■■■ 28.8
LARP4Q71RC2 RPL10P16-201ENST00000325000 645 ntBASIC6.87□□□□□ -1.314e-16■■■■■ 28.8
LARP4Q71RC2 TMEM179B-203ENST00000532345 845 ntTSL 29.18□□□□□ -0.943e-11■■■■■ 28.8
LARP4Q71RC2 PYM1-203ENST00000408946 1226 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.467e-8■■■■■ 28.8
LARP4Q71RC2 PYM1-201ENST00000302533 890 ntTSL 310.07□□□□□ -0.87e-8■■■■■ 28.8
LARP4Q71RC2 PYM1-202ENST00000398213 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.857e-8■■■■■ 28.8
LARP4Q71RC2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.32e-6■■■■■ 28.8
LARP4Q71RC2 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.132e-6■■■■■ 28.8
LARP4Q71RC2 COMMD4-208ENST00000563220 1897 ntTSL 217.61■□□□□ 0.414e-6■■■■■ 28.7
LARP4Q71RC2 COMMD4-215ENST00000566843 2284 ntTSL 215.77■□□□□ 0.124e-6■■■■■ 28.7
LARP4Q71RC2 COMMD4-206ENST00000562610 850 ntTSL 314.78□□□□□ -0.044e-6■■■■■ 28.7
LARP4Q71RC2 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.044e-6■■■■■ 28.7
LARP4Q71RC2 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.14e-6■■■■■ 28.7
LARP4Q71RC2 COMMD4-221ENST00000567935 502 ntTSL 314.29□□□□□ -0.124e-6■■■■■ 28.7
LARP4Q71RC2 COMMD4-225ENST00000569245 867 ntTSL 213.53□□□□□ -0.244e-6■■■■■ 28.7
LARP4Q71RC2 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.354e-6■■■■■ 28.7
LARP4Q71RC2 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.354e-6■■■■■ 28.7
LARP4Q71RC2 COMMD4-209ENST00000564068 4204 nt12.34□□□□□ -0.434e-6■■■■■ 28.7
LARP4Q71RC2 COMMD4-203ENST00000480484 3225 ntTSL 1 (best)10□□□□□ -0.814e-6■■■■■ 28.7
LARP4Q71RC2 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.612e-6■■■■■ 28.7
LARP4Q71RC2 EHBP1-201ENST00000263991 5165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.872e-6■■■■■ 28.7
LARP4Q71RC2 EHBP1-202ENST00000405015 4108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.672e-6■■■■■ 28.7
LARP4Q71RC2 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.629e-8■■■■■ 28.7
LARP4Q71RC2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.239e-8■■■■■ 28.7
LARP4Q71RC2 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.159e-8■■■■■ 28.7
LARP4Q71RC2 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.311e-11■■■■■ 28.7
LARP4Q71RC2 APOC1-209ENST00000592885 562 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.483e-11■■■■■ 28.6
LARP4Q71RC2 APOC1-206ENST00000590334 508 ntTSL 511.41□□□□□ -0.583e-11■■■■■ 28.6
LARP4Q71RC2 APOC1-201ENST00000586638 425 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.833e-11■■■■■ 28.6
LARP4Q71RC2 APOC1-203ENST00000588802 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.833e-11■■■■■ 28.6
LARP4Q71RC2 APOC1-205ENST00000589781 273 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.833e-11■■■■■ 28.6
LARP4Q71RC2 APOC1-207ENST00000592176 514 ntTSL 58.25□□□□□ -1.093e-11■■■■■ 28.6
LARP4Q71RC2 APOC1-202ENST00000588750 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.193e-11■■■■■ 28.6
LARP4Q71RC2 COX6C-211ENST00000606245 646 nt10.68□□□□□ -0.73e-41■■■■■ 28.6
LARP4Q71RC2 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.851e-6■■■■■ 28.6
LARP4Q71RC2 ADARB1-212ENST00000496664 5033 ntTSL 1 (best)20.38■□□□□ 0.851e-6■■■■■ 28.6
LARP4Q71RC2 ADARB1-203ENST00000389861 5031 ntTSL 1 (best)20.38■□□□□ 0.851e-6■■■■■ 28.6
LARP4Q71RC2 ADARB1-211ENST00000492414 4913 ntTSL 1 (best)19.54■□□□□ 0.721e-6■■■■■ 28.6
LARP4Q71RC2 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.391e-6■■■■■ 28.6
LARP4Q71RC2 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.251e-6■■■■■ 28.6
LARP4Q71RC2 ADARB1-206ENST00000449478 704 ntTSL 514.54□□□□□ -0.081e-6■■■■■ 28.6
LARP4Q71RC2 ADARB1-214ENST00000629643 4583 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.481e-6■■■■■ 28.6
LARP4Q71RC2 ADARB1-209ENST00000464215 389 ntTSL 36.59□□□□□ -1.351e-6■■■■■ 28.6
LARP4Q71RC2 TUBB3-209ENST00000555609 1855 ntTSL 316.25■□□□□ 0.192e-6■■■■■ 28.5
LARP4Q71RC2 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.092e-6■■■■■ 28.5
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