Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ2

USP34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, humanhuman

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Length 3,546 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP34Q70CQ2 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP34Q70CQ2 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
USP34Q70CQ2 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP34Q70CQ2 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP34Q70CQ2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP34Q70CQ2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP34Q70CQ2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP34Q70CQ2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP34Q70CQ2 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP34Q70CQ2 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
USP34Q70CQ2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP34Q70CQ2 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
USP34Q70CQ2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP34Q70CQ2 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP34Q70CQ2 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
USP34Q70CQ2 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP34Q70CQ2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP34Q70CQ2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP34Q70CQ2 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
USP34Q70CQ2 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP34Q70CQ2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP34Q70CQ2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP34Q70CQ2 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP34Q70CQ2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP34Q70CQ2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP34Q70CQ2 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP34Q70CQ2 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP34Q70CQ2 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP34Q70CQ2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP34Q70CQ2 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP34Q70CQ2 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP34Q70CQ2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP34Q70CQ2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP34Q70CQ2 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
USP34Q70CQ2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP34Q70CQ2 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP34Q70CQ2 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP34Q70CQ2 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP34Q70CQ2 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP34Q70CQ2 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP34Q70CQ2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP34Q70CQ2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP34Q70CQ2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP34Q70CQ2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP34Q70CQ2 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP34Q70CQ2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP34Q70CQ2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP34Q70CQ2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP34Q70CQ2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP34Q70CQ2 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
USP34Q70CQ2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP34Q70CQ2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP34Q70CQ2 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP34Q70CQ2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP34Q70CQ2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP34Q70CQ2 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP34Q70CQ2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP34Q70CQ2 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP34Q70CQ2 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP34Q70CQ2 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
USP34Q70CQ2 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
USP34Q70CQ2 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
USP34Q70CQ2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP34Q70CQ2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP34Q70CQ2 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP34Q70CQ2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
USP34Q70CQ2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP34Q70CQ2 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP34Q70CQ2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP34Q70CQ2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP34Q70CQ2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP34Q70CQ2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP34Q70CQ2 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP34Q70CQ2 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP34Q70CQ2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
USP34Q70CQ2 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP34Q70CQ2 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP34Q70CQ2 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP34Q70CQ2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP34Q70CQ2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP34Q70CQ2 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
USP34Q70CQ2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP34Q70CQ2 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP34Q70CQ2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP34Q70CQ2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP34Q70CQ2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP34Q70CQ2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP34Q70CQ2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP34Q70CQ2 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP34Q70CQ2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP34Q70CQ2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP34Q70CQ2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP34Q70CQ2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP34Q70CQ2 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP34Q70CQ2 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP34Q70CQ2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP34Q70CQ2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP34Q70CQ2 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP34Q70CQ2 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
USP34Q70CQ2 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
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