Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUS6

CCDC149, Coiled-coil domain-containing protein 149, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC149Q6ZUS6 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC149Q6ZUS6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC149Q6ZUS6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC149Q6ZUS6 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC149Q6ZUS6 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC149Q6ZUS6 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC149Q6ZUS6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC149Q6ZUS6 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC149Q6ZUS6 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC149Q6ZUS6 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC149Q6ZUS6 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC149Q6ZUS6 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC149Q6ZUS6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC149Q6ZUS6 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC149Q6ZUS6 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC149Q6ZUS6 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC149Q6ZUS6 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC149Q6ZUS6 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC149Q6ZUS6 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC149Q6ZUS6 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC149Q6ZUS6 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC149Q6ZUS6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC149Q6ZUS6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC149Q6ZUS6 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC149Q6ZUS6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC149Q6ZUS6 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC149Q6ZUS6 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC149Q6ZUS6 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC149Q6ZUS6 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC149Q6ZUS6 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC149Q6ZUS6 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC149Q6ZUS6 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC149Q6ZUS6 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC149Q6ZUS6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CCDC149Q6ZUS6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CCDC149Q6ZUS6 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC149Q6ZUS6 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC149Q6ZUS6 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC149Q6ZUS6 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC149Q6ZUS6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC149Q6ZUS6 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC149Q6ZUS6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC149Q6ZUS6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC149Q6ZUS6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC149Q6ZUS6 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC149Q6ZUS6 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC149Q6ZUS6 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC149Q6ZUS6 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC149Q6ZUS6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC149Q6ZUS6 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC149Q6ZUS6 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC149Q6ZUS6 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC149Q6ZUS6 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC149Q6ZUS6 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC149Q6ZUS6 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC149Q6ZUS6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC149Q6ZUS6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC149Q6ZUS6 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC149Q6ZUS6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC149Q6ZUS6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC149Q6ZUS6 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC149Q6ZUS6 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC149Q6ZUS6 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC149Q6ZUS6 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC149Q6ZUS6 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC149Q6ZUS6 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC149Q6ZUS6 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC149Q6ZUS6 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC149Q6ZUS6 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC149Q6ZUS6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC149Q6ZUS6 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC149Q6ZUS6 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC149Q6ZUS6 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC149Q6ZUS6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC149Q6ZUS6 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC149Q6ZUS6 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC149Q6ZUS6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC149Q6ZUS6 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC149Q6ZUS6 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC149Q6ZUS6 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC149Q6ZUS6 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC149Q6ZUS6 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC149Q6ZUS6 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC149Q6ZUS6 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC149Q6ZUS6 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC149Q6ZUS6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC149Q6ZUS6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC149Q6ZUS6 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC149Q6ZUS6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC149Q6ZUS6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC149Q6ZUS6 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC149Q6ZUS6 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC149Q6ZUS6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC149Q6ZUS6 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC149Q6ZUS6 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC149Q6ZUS6 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC149Q6ZUS6 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC149Q6ZUS6 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC149Q6ZUS6 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC149Q6ZUS6 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms