Protein–RNA interactions for Protein: Q6XYB7

LBX2, Transcription factor LBX2, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LBX2Q6XYB7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LBX2Q6XYB7 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LBX2Q6XYB7 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LBX2Q6XYB7 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LBX2Q6XYB7 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LBX2Q6XYB7 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LBX2Q6XYB7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LBX2Q6XYB7 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
LBX2Q6XYB7 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
LBX2Q6XYB7 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
LBX2Q6XYB7 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
LBX2Q6XYB7 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
LBX2Q6XYB7 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LBX2Q6XYB7 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LBX2Q6XYB7 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LBX2Q6XYB7 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LBX2Q6XYB7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LBX2Q6XYB7 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LBX2Q6XYB7 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LBX2Q6XYB7 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LBX2Q6XYB7 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LBX2Q6XYB7 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
LBX2Q6XYB7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LBX2Q6XYB7 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LBX2Q6XYB7 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LBX2Q6XYB7 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LBX2Q6XYB7 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LBX2Q6XYB7 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LBX2Q6XYB7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LBX2Q6XYB7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LBX2Q6XYB7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LBX2Q6XYB7 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LBX2Q6XYB7 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LBX2Q6XYB7 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LBX2Q6XYB7 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LBX2Q6XYB7 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
LBX2Q6XYB7 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LBX2Q6XYB7 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LBX2Q6XYB7 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LBX2Q6XYB7 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LBX2Q6XYB7 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
LBX2Q6XYB7 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
LBX2Q6XYB7 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
LBX2Q6XYB7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
LBX2Q6XYB7 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
LBX2Q6XYB7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
LBX2Q6XYB7 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
LBX2Q6XYB7 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
LBX2Q6XYB7 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
LBX2Q6XYB7 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
LBX2Q6XYB7 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
LBX2Q6XYB7 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
LBX2Q6XYB7 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LBX2Q6XYB7 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LBX2Q6XYB7 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LBX2Q6XYB7 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LBX2Q6XYB7 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LBX2Q6XYB7 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LBX2Q6XYB7 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LBX2Q6XYB7 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LBX2Q6XYB7 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LBX2Q6XYB7 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LBX2Q6XYB7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LBX2Q6XYB7 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LBX2Q6XYB7 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LBX2Q6XYB7 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
LBX2Q6XYB7 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LBX2Q6XYB7 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LBX2Q6XYB7 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LBX2Q6XYB7 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LBX2Q6XYB7 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LBX2Q6XYB7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LBX2Q6XYB7 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LBX2Q6XYB7 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LBX2Q6XYB7 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LBX2Q6XYB7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LBX2Q6XYB7 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LBX2Q6XYB7 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
LBX2Q6XYB7 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
LBX2Q6XYB7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LBX2Q6XYB7 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LBX2Q6XYB7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LBX2Q6XYB7 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
LBX2Q6XYB7 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
LBX2Q6XYB7 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
LBX2Q6XYB7 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
LBX2Q6XYB7 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LBX2Q6XYB7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LBX2Q6XYB7 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LBX2Q6XYB7 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
LBX2Q6XYB7 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LBX2Q6XYB7 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LBX2Q6XYB7 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LBX2Q6XYB7 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LBX2Q6XYB7 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LBX2Q6XYB7 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LBX2Q6XYB7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LBX2Q6XYB7 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LBX2Q6XYB7 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LBX2Q6XYB7 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms