Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXC1

MAMDC4, Apical endosomal glycoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAMDC4Q6UXC1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MAMDC4Q6UXC1 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MAMDC4Q6UXC1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MAMDC4Q6UXC1 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MAMDC4Q6UXC1 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MAMDC4Q6UXC1 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MAMDC4Q6UXC1 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MAMDC4Q6UXC1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MAMDC4Q6UXC1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MAMDC4Q6UXC1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MAMDC4Q6UXC1 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MAMDC4Q6UXC1 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MAMDC4Q6UXC1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MAMDC4Q6UXC1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
MAMDC4Q6UXC1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MAMDC4Q6UXC1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MAMDC4Q6UXC1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MAMDC4Q6UXC1 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MAMDC4Q6UXC1 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MAMDC4Q6UXC1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MAMDC4Q6UXC1 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MAMDC4Q6UXC1 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MAMDC4Q6UXC1 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
MAMDC4Q6UXC1 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MAMDC4Q6UXC1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MAMDC4Q6UXC1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MAMDC4Q6UXC1 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MAMDC4Q6UXC1 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MAMDC4Q6UXC1 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
MAMDC4Q6UXC1 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MAMDC4Q6UXC1 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MAMDC4Q6UXC1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MAMDC4Q6UXC1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MAMDC4Q6UXC1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MAMDC4Q6UXC1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MAMDC4Q6UXC1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MAMDC4Q6UXC1 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MAMDC4Q6UXC1 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MAMDC4Q6UXC1 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MAMDC4Q6UXC1 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
MAMDC4Q6UXC1 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MAMDC4Q6UXC1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MAMDC4Q6UXC1 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MAMDC4Q6UXC1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MAMDC4Q6UXC1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MAMDC4Q6UXC1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MAMDC4Q6UXC1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MAMDC4Q6UXC1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MAMDC4Q6UXC1 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MAMDC4Q6UXC1 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MAMDC4Q6UXC1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MAMDC4Q6UXC1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
MAMDC4Q6UXC1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MAMDC4Q6UXC1 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MAMDC4Q6UXC1 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MAMDC4Q6UXC1 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MAMDC4Q6UXC1 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MAMDC4Q6UXC1 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MAMDC4Q6UXC1 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MAMDC4Q6UXC1 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MAMDC4Q6UXC1 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MAMDC4Q6UXC1 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MAMDC4Q6UXC1 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MAMDC4Q6UXC1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MAMDC4Q6UXC1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MAMDC4Q6UXC1 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MAMDC4Q6UXC1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MAMDC4Q6UXC1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MAMDC4Q6UXC1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MAMDC4Q6UXC1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MAMDC4Q6UXC1 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MAMDC4Q6UXC1 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MAMDC4Q6UXC1 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
MAMDC4Q6UXC1 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MAMDC4Q6UXC1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MAMDC4Q6UXC1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MAMDC4Q6UXC1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MAMDC4Q6UXC1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MAMDC4Q6UXC1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MAMDC4Q6UXC1 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MAMDC4Q6UXC1 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MAMDC4Q6UXC1 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MAMDC4Q6UXC1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MAMDC4Q6UXC1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MAMDC4Q6UXC1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MAMDC4Q6UXC1 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
MAMDC4Q6UXC1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MAMDC4Q6UXC1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MAMDC4Q6UXC1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MAMDC4Q6UXC1 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MAMDC4Q6UXC1 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
MAMDC4Q6UXC1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MAMDC4Q6UXC1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MAMDC4Q6UXC1 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MAMDC4Q6UXC1 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MAMDC4Q6UXC1 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MAMDC4Q6UXC1 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MAMDC4Q6UXC1 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MAMDC4Q6UXC1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MAMDC4Q6UXC1 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms