Protein–RNA interactions for Protein: Q6SPF0

SAMD1, Atherin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD1Q6SPF0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SAMD1Q6SPF0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SAMD1Q6SPF0 DCD-201ENST00000293371 645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SAMD1Q6SPF0 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SAMD1Q6SPF0 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SAMD1Q6SPF0 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.53■■■□□ 2
SAMD1Q6SPF0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.52■■■□□ 2
SAMD1Q6SPF0 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SAMD1Q6SPF0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
SAMD1Q6SPF0 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SAMD1Q6SPF0 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SAMD1Q6SPF0 NIFKP4-201ENST00000567275 1192 ntBASIC27.52■■■□□ 2
SAMD1Q6SPF0 AC012183.1-201ENST00000625197 499 ntBASIC27.52■■■□□ 2
SAMD1Q6SPF0 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SAMD1Q6SPF0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
SAMD1Q6SPF0 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
SAMD1Q6SPF0 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SAMD1Q6SPF0 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SAMD1Q6SPF0 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SAMD1Q6SPF0 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SAMD1Q6SPF0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SAMD1Q6SPF0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SAMD1Q6SPF0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SAMD1Q6SPF0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SAMD1Q6SPF0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SAMD1Q6SPF0 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SAMD1Q6SPF0 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SAMD1Q6SPF0 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SAMD1Q6SPF0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SAMD1Q6SPF0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SAMD1Q6SPF0 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SAMD1Q6SPF0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SAMD1Q6SPF0 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SAMD1Q6SPF0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SAMD1Q6SPF0 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SAMD1Q6SPF0 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SAMD1Q6SPF0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SAMD1Q6SPF0 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SAMD1Q6SPF0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SAMD1Q6SPF0 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SAMD1Q6SPF0 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
SAMD1Q6SPF0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SAMD1Q6SPF0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SAMD1Q6SPF0 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SAMD1Q6SPF0 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SAMD1Q6SPF0 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SAMD1Q6SPF0 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SAMD1Q6SPF0 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SAMD1Q6SPF0 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SAMD1Q6SPF0 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SAMD1Q6SPF0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SAMD1Q6SPF0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SAMD1Q6SPF0 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SAMD1Q6SPF0 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SAMD1Q6SPF0 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SAMD1Q6SPF0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SAMD1Q6SPF0 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SAMD1Q6SPF0 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
SAMD1Q6SPF0 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SAMD1Q6SPF0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SAMD1Q6SPF0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SAMD1Q6SPF0 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SAMD1Q6SPF0 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SAMD1Q6SPF0 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SAMD1Q6SPF0 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SAMD1Q6SPF0 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SAMD1Q6SPF0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SAMD1Q6SPF0 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SAMD1Q6SPF0 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
SAMD1Q6SPF0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SAMD1Q6SPF0 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SAMD1Q6SPF0 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SAMD1Q6SPF0 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SAMD1Q6SPF0 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SAMD1Q6SPF0 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SAMD1Q6SPF0 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SAMD1Q6SPF0 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SAMD1Q6SPF0 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
SAMD1Q6SPF0 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
SAMD1Q6SPF0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SAMD1Q6SPF0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SAMD1Q6SPF0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SAMD1Q6SPF0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SAMD1Q6SPF0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SAMD1Q6SPF0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
SAMD1Q6SPF0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SAMD1Q6SPF0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SAMD1Q6SPF0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SAMD1Q6SPF0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SAMD1Q6SPF0 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SAMD1Q6SPF0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SAMD1Q6SPF0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SAMD1Q6SPF0 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SAMD1Q6SPF0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SAMD1Q6SPF0 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SAMD1Q6SPF0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SAMD1Q6SPF0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SAMD1Q6SPF0 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SAMD1Q6SPF0 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SAMD1Q6SPF0 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms