Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
TRAF7Q6Q0C0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRAF7Q6Q0C0 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRAF7Q6Q0C0 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRAF7Q6Q0C0 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
TRAF7Q6Q0C0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRAF7Q6Q0C0 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRAF7Q6Q0C0 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRAF7Q6Q0C0 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRAF7Q6Q0C0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRAF7Q6Q0C0 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRAF7Q6Q0C0 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRAF7Q6Q0C0 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRAF7Q6Q0C0 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRAF7Q6Q0C0 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRAF7Q6Q0C0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TRAF7Q6Q0C0 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRAF7Q6Q0C0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26■■□□□ 1.75
TRAF7Q6Q0C0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRAF7Q6Q0C0 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TRAF7Q6Q0C0 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26■■□□□ 1.75
TRAF7Q6Q0C0 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
TRAF7Q6Q0C0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRAF7Q6Q0C0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TRAF7Q6Q0C0 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRAF7Q6Q0C0 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRAF7Q6Q0C0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRAF7Q6Q0C0 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRAF7Q6Q0C0 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRAF7Q6Q0C0 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRAF7Q6Q0C0 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRAF7Q6Q0C0 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRAF7Q6Q0C0 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRAF7Q6Q0C0 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRAF7Q6Q0C0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRAF7Q6Q0C0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRAF7Q6Q0C0 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRAF7Q6Q0C0 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRAF7Q6Q0C0 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRAF7Q6Q0C0 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRAF7Q6Q0C0 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRAF7Q6Q0C0 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRAF7Q6Q0C0 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRAF7Q6Q0C0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRAF7Q6Q0C0 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRAF7Q6Q0C0 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRAF7Q6Q0C0 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
TRAF7Q6Q0C0 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
TRAF7Q6Q0C0 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRAF7Q6Q0C0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRAF7Q6Q0C0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TRAF7Q6Q0C0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TRAF7Q6Q0C0 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRAF7Q6Q0C0 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRAF7Q6Q0C0 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
TRAF7Q6Q0C0 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRAF7Q6Q0C0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRAF7Q6Q0C0 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRAF7Q6Q0C0 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRAF7Q6Q0C0 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRAF7Q6Q0C0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRAF7Q6Q0C0 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRAF7Q6Q0C0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRAF7Q6Q0C0 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRAF7Q6Q0C0 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRAF7Q6Q0C0 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRAF7Q6Q0C0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRAF7Q6Q0C0 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRAF7Q6Q0C0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRAF7Q6Q0C0 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRAF7Q6Q0C0 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRAF7Q6Q0C0 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
TRAF7Q6Q0C0 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRAF7Q6Q0C0 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRAF7Q6Q0C0 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRAF7Q6Q0C0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRAF7Q6Q0C0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRAF7Q6Q0C0 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRAF7Q6Q0C0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRAF7Q6Q0C0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRAF7Q6Q0C0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRAF7Q6Q0C0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRAF7Q6Q0C0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRAF7Q6Q0C0 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
TRAF7Q6Q0C0 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRAF7Q6Q0C0 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRAF7Q6Q0C0 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRAF7Q6Q0C0 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRAF7Q6Q0C0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRAF7Q6Q0C0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRAF7Q6Q0C0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRAF7Q6Q0C0 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
TRAF7Q6Q0C0 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRAF7Q6Q0C0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRAF7Q6Q0C0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRAF7Q6Q0C0 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRAF7Q6Q0C0 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRAF7Q6Q0C0 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRAF7Q6Q0C0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRAF7Q6Q0C0 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms