Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD62

CTR9, RNA polymerase-associated protein CTR9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTR9Q6PD62 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
CTR9Q6PD62 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CTR9Q6PD62 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CTR9Q6PD62 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CTR9Q6PD62 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
CTR9Q6PD62 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CTR9Q6PD62 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CTR9Q6PD62 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CTR9Q6PD62 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CTR9Q6PD62 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CTR9Q6PD62 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CTR9Q6PD62 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CTR9Q6PD62 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CTR9Q6PD62 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CTR9Q6PD62 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CTR9Q6PD62 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CTR9Q6PD62 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CTR9Q6PD62 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CTR9Q6PD62 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CTR9Q6PD62 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CTR9Q6PD62 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CTR9Q6PD62 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CTR9Q6PD62 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CTR9Q6PD62 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CTR9Q6PD62 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
CTR9Q6PD62 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CTR9Q6PD62 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CTR9Q6PD62 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CTR9Q6PD62 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CTR9Q6PD62 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CTR9Q6PD62 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CTR9Q6PD62 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CTR9Q6PD62 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CTR9Q6PD62 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CTR9Q6PD62 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CTR9Q6PD62 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CTR9Q6PD62 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CTR9Q6PD62 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CTR9Q6PD62 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CTR9Q6PD62 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CTR9Q6PD62 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CTR9Q6PD62 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CTR9Q6PD62 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CTR9Q6PD62 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CTR9Q6PD62 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CTR9Q6PD62 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CTR9Q6PD62 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CTR9Q6PD62 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CTR9Q6PD62 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CTR9Q6PD62 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CTR9Q6PD62 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CTR9Q6PD62 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CTR9Q6PD62 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CTR9Q6PD62 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CTR9Q6PD62 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CTR9Q6PD62 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CTR9Q6PD62 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CTR9Q6PD62 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CTR9Q6PD62 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CTR9Q6PD62 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CTR9Q6PD62 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CTR9Q6PD62 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CTR9Q6PD62 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CTR9Q6PD62 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CTR9Q6PD62 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CTR9Q6PD62 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CTR9Q6PD62 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CTR9Q6PD62 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CTR9Q6PD62 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CTR9Q6PD62 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CTR9Q6PD62 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CTR9Q6PD62 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CTR9Q6PD62 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CTR9Q6PD62 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CTR9Q6PD62 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CTR9Q6PD62 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CTR9Q6PD62 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CTR9Q6PD62 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CTR9Q6PD62 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CTR9Q6PD62 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CTR9Q6PD62 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CTR9Q6PD62 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CTR9Q6PD62 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CTR9Q6PD62 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CTR9Q6PD62 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CTR9Q6PD62 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CTR9Q6PD62 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CTR9Q6PD62 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CTR9Q6PD62 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CTR9Q6PD62 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CTR9Q6PD62 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CTR9Q6PD62 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CTR9Q6PD62 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CTR9Q6PD62 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CTR9Q6PD62 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CTR9Q6PD62 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CTR9Q6PD62 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CTR9Q6PD62 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CTR9Q6PD62 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CTR9Q6PD62 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms