Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2S7

TTC41P, Putative tetratricopeptide repeat protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC41PQ6P2S7 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
TTC41PQ6P2S7 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TTC41PQ6P2S7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TTC41PQ6P2S7 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TTC41PQ6P2S7 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TTC41PQ6P2S7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TTC41PQ6P2S7 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TTC41PQ6P2S7 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
TTC41PQ6P2S7 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TTC41PQ6P2S7 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TTC41PQ6P2S7 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TTC41PQ6P2S7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TTC41PQ6P2S7 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TTC41PQ6P2S7 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TTC41PQ6P2S7 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TTC41PQ6P2S7 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TTC41PQ6P2S7 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TTC41PQ6P2S7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TTC41PQ6P2S7 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
TTC41PQ6P2S7 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TTC41PQ6P2S7 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
TTC41PQ6P2S7 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
TTC41PQ6P2S7 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TTC41PQ6P2S7 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TTC41PQ6P2S7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TTC41PQ6P2S7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TTC41PQ6P2S7 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TTC41PQ6P2S7 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TTC41PQ6P2S7 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TTC41PQ6P2S7 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TTC41PQ6P2S7 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TTC41PQ6P2S7 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TTC41PQ6P2S7 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TTC41PQ6P2S7 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TTC41PQ6P2S7 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TTC41PQ6P2S7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TTC41PQ6P2S7 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TTC41PQ6P2S7 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
TTC41PQ6P2S7 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TTC41PQ6P2S7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TTC41PQ6P2S7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TTC41PQ6P2S7 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TTC41PQ6P2S7 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TTC41PQ6P2S7 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TTC41PQ6P2S7 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TTC41PQ6P2S7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TTC41PQ6P2S7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TTC41PQ6P2S7 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TTC41PQ6P2S7 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TTC41PQ6P2S7 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TTC41PQ6P2S7 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
TTC41PQ6P2S7 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TTC41PQ6P2S7 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TTC41PQ6P2S7 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TTC41PQ6P2S7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TTC41PQ6P2S7 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TTC41PQ6P2S7 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TTC41PQ6P2S7 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TTC41PQ6P2S7 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TTC41PQ6P2S7 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TTC41PQ6P2S7 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TTC41PQ6P2S7 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TTC41PQ6P2S7 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TTC41PQ6P2S7 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TTC41PQ6P2S7 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TTC41PQ6P2S7 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TTC41PQ6P2S7 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
TTC41PQ6P2S7 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TTC41PQ6P2S7 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TTC41PQ6P2S7 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TTC41PQ6P2S7 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TTC41PQ6P2S7 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC28.76■■■□□ 2.2
TTC41PQ6P2S7 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TTC41PQ6P2S7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TTC41PQ6P2S7 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TTC41PQ6P2S7 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TTC41PQ6P2S7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TTC41PQ6P2S7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TTC41PQ6P2S7 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TTC41PQ6P2S7 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TTC41PQ6P2S7 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TTC41PQ6P2S7 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TTC41PQ6P2S7 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TTC41PQ6P2S7 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TTC41PQ6P2S7 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
TTC41PQ6P2S7 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TTC41PQ6P2S7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TTC41PQ6P2S7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TTC41PQ6P2S7 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TTC41PQ6P2S7 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TTC41PQ6P2S7 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TTC41PQ6P2S7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TTC41PQ6P2S7 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TTC41PQ6P2S7 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TTC41PQ6P2S7 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TTC41PQ6P2S7 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TTC41PQ6P2S7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TTC41PQ6P2S7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TTC41PQ6P2S7 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TTC41PQ6P2S7 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms