Protein–RNA interactions for Protein: Q6NX49

ZNF544, Zinc finger protein 544, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF544Q6NX49 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF544Q6NX49 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF544Q6NX49 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF544Q6NX49 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF544Q6NX49 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF544Q6NX49 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF544Q6NX49 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF544Q6NX49 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF544Q6NX49 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF544Q6NX49 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF544Q6NX49 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF544Q6NX49 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF544Q6NX49 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF544Q6NX49 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF544Q6NX49 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF544Q6NX49 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF544Q6NX49 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF544Q6NX49 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF544Q6NX49 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF544Q6NX49 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF544Q6NX49 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF544Q6NX49 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF544Q6NX49 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF544Q6NX49 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ZNF544Q6NX49 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF544Q6NX49 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF544Q6NX49 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF544Q6NX49 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF544Q6NX49 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF544Q6NX49 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF544Q6NX49 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF544Q6NX49 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF544Q6NX49 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF544Q6NX49 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF544Q6NX49 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF544Q6NX49 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF544Q6NX49 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF544Q6NX49 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF544Q6NX49 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF544Q6NX49 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF544Q6NX49 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF544Q6NX49 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF544Q6NX49 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF544Q6NX49 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF544Q6NX49 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF544Q6NX49 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF544Q6NX49 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF544Q6NX49 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF544Q6NX49 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF544Q6NX49 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF544Q6NX49 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF544Q6NX49 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF544Q6NX49 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF544Q6NX49 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF544Q6NX49 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF544Q6NX49 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF544Q6NX49 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF544Q6NX49 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF544Q6NX49 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF544Q6NX49 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF544Q6NX49 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF544Q6NX49 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF544Q6NX49 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF544Q6NX49 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF544Q6NX49 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF544Q6NX49 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF544Q6NX49 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF544Q6NX49 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF544Q6NX49 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF544Q6NX49 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF544Q6NX49 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF544Q6NX49 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF544Q6NX49 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF544Q6NX49 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF544Q6NX49 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF544Q6NX49 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ZNF544Q6NX49 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ZNF544Q6NX49 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ZNF544Q6NX49 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF544Q6NX49 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF544Q6NX49 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF544Q6NX49 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF544Q6NX49 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF544Q6NX49 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF544Q6NX49 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ZNF544Q6NX49 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF544Q6NX49 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF544Q6NX49 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF544Q6NX49 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF544Q6NX49 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF544Q6NX49 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF544Q6NX49 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF544Q6NX49 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF544Q6NX49 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF544Q6NX49 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF544Q6NX49 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF544Q6NX49 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF544Q6NX49 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF544Q6NX49 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF544Q6NX49 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms