Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI14

SLC9A4, Sodium/hydrogen exchanger 4, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A4Q6AI14 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC9A4Q6AI14 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC9A4Q6AI14 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC9A4Q6AI14 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC9A4Q6AI14 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC9A4Q6AI14 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC9A4Q6AI14 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC9A4Q6AI14 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC9A4Q6AI14 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC9A4Q6AI14 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC9A4Q6AI14 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC9A4Q6AI14 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC9A4Q6AI14 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC9A4Q6AI14 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC9A4Q6AI14 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC9A4Q6AI14 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC9A4Q6AI14 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC9A4Q6AI14 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC9A4Q6AI14 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC9A4Q6AI14 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC9A4Q6AI14 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC9A4Q6AI14 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SLC9A4Q6AI14 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC9A4Q6AI14 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC9A4Q6AI14 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC9A4Q6AI14 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC9A4Q6AI14 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC9A4Q6AI14 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC9A4Q6AI14 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC9A4Q6AI14 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC9A4Q6AI14 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC9A4Q6AI14 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC9A4Q6AI14 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC9A4Q6AI14 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC9A4Q6AI14 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC9A4Q6AI14 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC9A4Q6AI14 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC9A4Q6AI14 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC9A4Q6AI14 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC9A4Q6AI14 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC9A4Q6AI14 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC9A4Q6AI14 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC9A4Q6AI14 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC9A4Q6AI14 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC9A4Q6AI14 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC9A4Q6AI14 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC9A4Q6AI14 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC9A4Q6AI14 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC9A4Q6AI14 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC9A4Q6AI14 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC9A4Q6AI14 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC9A4Q6AI14 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC9A4Q6AI14 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC9A4Q6AI14 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC9A4Q6AI14 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC9A4Q6AI14 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC9A4Q6AI14 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC9A4Q6AI14 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC9A4Q6AI14 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC9A4Q6AI14 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC9A4Q6AI14 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC9A4Q6AI14 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC9A4Q6AI14 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC9A4Q6AI14 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC9A4Q6AI14 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC9A4Q6AI14 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC9A4Q6AI14 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC9A4Q6AI14 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC9A4Q6AI14 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC9A4Q6AI14 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC9A4Q6AI14 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC9A4Q6AI14 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC9A4Q6AI14 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC9A4Q6AI14 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC9A4Q6AI14 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC9A4Q6AI14 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC9A4Q6AI14 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC9A4Q6AI14 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC9A4Q6AI14 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC9A4Q6AI14 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC9A4Q6AI14 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC9A4Q6AI14 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC9A4Q6AI14 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC9A4Q6AI14 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC9A4Q6AI14 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC9A4Q6AI14 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC9A4Q6AI14 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC9A4Q6AI14 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC9A4Q6AI14 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC9A4Q6AI14 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC9A4Q6AI14 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC9A4Q6AI14 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC9A4Q6AI14 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC9A4Q6AI14 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC9A4Q6AI14 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC9A4Q6AI14 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC9A4Q6AI14 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC9A4Q6AI14 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC9A4Q6AI14 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC9A4Q6AI14 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.2 ms