Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0N0

C9orf57, Uncharacterized protein C9orf57, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf57Q5W0N0 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
C9orf57Q5W0N0 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
C9orf57Q5W0N0 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
C9orf57Q5W0N0 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
C9orf57Q5W0N0 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
C9orf57Q5W0N0 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
C9orf57Q5W0N0 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
C9orf57Q5W0N0 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
C9orf57Q5W0N0 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
C9orf57Q5W0N0 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
C9orf57Q5W0N0 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
C9orf57Q5W0N0 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
C9orf57Q5W0N0 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
C9orf57Q5W0N0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
C9orf57Q5W0N0 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
C9orf57Q5W0N0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
C9orf57Q5W0N0 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
C9orf57Q5W0N0 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
C9orf57Q5W0N0 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
C9orf57Q5W0N0 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
C9orf57Q5W0N0 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
C9orf57Q5W0N0 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
C9orf57Q5W0N0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
C9orf57Q5W0N0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
C9orf57Q5W0N0 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
C9orf57Q5W0N0 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
C9orf57Q5W0N0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
C9orf57Q5W0N0 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
C9orf57Q5W0N0 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
C9orf57Q5W0N0 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
C9orf57Q5W0N0 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
C9orf57Q5W0N0 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
C9orf57Q5W0N0 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
C9orf57Q5W0N0 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
C9orf57Q5W0N0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
C9orf57Q5W0N0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
C9orf57Q5W0N0 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
C9orf57Q5W0N0 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
C9orf57Q5W0N0 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
C9orf57Q5W0N0 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
C9orf57Q5W0N0 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
C9orf57Q5W0N0 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
C9orf57Q5W0N0 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
C9orf57Q5W0N0 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
C9orf57Q5W0N0 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
C9orf57Q5W0N0 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
C9orf57Q5W0N0 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
C9orf57Q5W0N0 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
C9orf57Q5W0N0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
C9orf57Q5W0N0 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
C9orf57Q5W0N0 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
C9orf57Q5W0N0 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
C9orf57Q5W0N0 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
C9orf57Q5W0N0 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
C9orf57Q5W0N0 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
C9orf57Q5W0N0 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
C9orf57Q5W0N0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
C9orf57Q5W0N0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
C9orf57Q5W0N0 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
C9orf57Q5W0N0 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
C9orf57Q5W0N0 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
C9orf57Q5W0N0 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
C9orf57Q5W0N0 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
C9orf57Q5W0N0 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
C9orf57Q5W0N0 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
C9orf57Q5W0N0 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
C9orf57Q5W0N0 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
C9orf57Q5W0N0 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
C9orf57Q5W0N0 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
C9orf57Q5W0N0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
C9orf57Q5W0N0 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
C9orf57Q5W0N0 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
C9orf57Q5W0N0 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
C9orf57Q5W0N0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
C9orf57Q5W0N0 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
C9orf57Q5W0N0 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
C9orf57Q5W0N0 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
C9orf57Q5W0N0 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
C9orf57Q5W0N0 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
C9orf57Q5W0N0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
C9orf57Q5W0N0 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
C9orf57Q5W0N0 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
C9orf57Q5W0N0 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
C9orf57Q5W0N0 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
C9orf57Q5W0N0 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
C9orf57Q5W0N0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
C9orf57Q5W0N0 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
C9orf57Q5W0N0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
C9orf57Q5W0N0 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
C9orf57Q5W0N0 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
C9orf57Q5W0N0 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
C9orf57Q5W0N0 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
C9orf57Q5W0N0 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
C9orf57Q5W0N0 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
C9orf57Q5W0N0 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
C9orf57Q5W0N0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
C9orf57Q5W0N0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
C9orf57Q5W0N0 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
C9orf57Q5W0N0 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
C9orf57Q5W0N0 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms