Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXU9

C9orf84, Uncharacterized protein C9orf84, humanhuman

Predictions only

Length 1,444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf84Q5VXU9 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
C9orf84Q5VXU9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
C9orf84Q5VXU9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
C9orf84Q5VXU9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
C9orf84Q5VXU9 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC36.15■■■■□ 3.38
C9orf84Q5VXU9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC36.14■■■■□ 3.38
C9orf84Q5VXU9 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
C9orf84Q5VXU9 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
C9orf84Q5VXU9 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
C9orf84Q5VXU9 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC36.13■■■■□ 3.37
C9orf84Q5VXU9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
C9orf84Q5VXU9 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC36.13■■■■□ 3.37
C9orf84Q5VXU9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
C9orf84Q5VXU9 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
C9orf84Q5VXU9 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
C9orf84Q5VXU9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
C9orf84Q5VXU9 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
C9orf84Q5VXU9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
C9orf84Q5VXU9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
C9orf84Q5VXU9 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
C9orf84Q5VXU9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
C9orf84Q5VXU9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
C9orf84Q5VXU9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
C9orf84Q5VXU9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
C9orf84Q5VXU9 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
C9orf84Q5VXU9 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
C9orf84Q5VXU9 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
C9orf84Q5VXU9 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
C9orf84Q5VXU9 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
C9orf84Q5VXU9 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
C9orf84Q5VXU9 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
C9orf84Q5VXU9 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
C9orf84Q5VXU9 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
C9orf84Q5VXU9 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
C9orf84Q5VXU9 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
C9orf84Q5VXU9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
C9orf84Q5VXU9 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.36
C9orf84Q5VXU9 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC36.07■■■■□ 3.36
C9orf84Q5VXU9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
C9orf84Q5VXU9 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
C9orf84Q5VXU9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
C9orf84Q5VXU9 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
C9orf84Q5VXU9 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
C9orf84Q5VXU9 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
C9orf84Q5VXU9 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
C9orf84Q5VXU9 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
C9orf84Q5VXU9 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC36.05■■■■□ 3.36
C9orf84Q5VXU9 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
C9orf84Q5VXU9 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC36.04■■■■□ 3.36
C9orf84Q5VXU9 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
C9orf84Q5VXU9 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC36.04■■■■□ 3.36
C9orf84Q5VXU9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
C9orf84Q5VXU9 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC36.03■■■■□ 3.36
C9orf84Q5VXU9 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
C9orf84Q5VXU9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
C9orf84Q5VXU9 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
C9orf84Q5VXU9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
C9orf84Q5VXU9 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC36.01■■■■□ 3.36
C9orf84Q5VXU9 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
C9orf84Q5VXU9 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
C9orf84Q5VXU9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
C9orf84Q5VXU9 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
C9orf84Q5VXU9 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC36■■■■□ 3.35
C9orf84Q5VXU9 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
C9orf84Q5VXU9 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC36■■■■□ 3.35
C9orf84Q5VXU9 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC36■■■■□ 3.35
C9orf84Q5VXU9 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
C9orf84Q5VXU9 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
C9orf84Q5VXU9 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
C9orf84Q5VXU9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
C9orf84Q5VXU9 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
C9orf84Q5VXU9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
C9orf84Q5VXU9 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC35.99■■■■□ 3.35
C9orf84Q5VXU9 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
C9orf84Q5VXU9 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
C9orf84Q5VXU9 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC35.98■■■■□ 3.35
C9orf84Q5VXU9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
C9orf84Q5VXU9 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
C9orf84Q5VXU9 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
C9orf84Q5VXU9 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
C9orf84Q5VXU9 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
C9orf84Q5VXU9 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
C9orf84Q5VXU9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
C9orf84Q5VXU9 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
C9orf84Q5VXU9 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
C9orf84Q5VXU9 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC35.96■■■■□ 3.35
C9orf84Q5VXU9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
C9orf84Q5VXU9 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC35.95■■■■□ 3.35
C9orf84Q5VXU9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
C9orf84Q5VXU9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.34
C9orf84Q5VXU9 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
C9orf84Q5VXU9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
C9orf84Q5VXU9 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
C9orf84Q5VXU9 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
C9orf84Q5VXU9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC35.93■■■■□ 3.34
C9orf84Q5VXU9 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
C9orf84Q5VXU9 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
C9orf84Q5VXU9 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
C9orf84Q5VXU9 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC35.92■■■■□ 3.34
C9orf84Q5VXU9 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms