Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWM3

PRAMEF18, PRAME family member 18, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF18Q5VWM3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRAMEF18Q5VWM3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
PRAMEF18Q5VWM3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
PRAMEF18Q5VWM3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRAMEF18Q5VWM3 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PRAMEF18Q5VWM3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PRAMEF18Q5VWM3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PRAMEF18Q5VWM3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PRAMEF18Q5VWM3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PRAMEF18Q5VWM3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRAMEF18Q5VWM3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRAMEF18Q5VWM3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRAMEF18Q5VWM3 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRAMEF18Q5VWM3 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRAMEF18Q5VWM3 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRAMEF18Q5VWM3 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
PRAMEF18Q5VWM3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRAMEF18Q5VWM3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
PRAMEF18Q5VWM3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRAMEF18Q5VWM3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRAMEF18Q5VWM3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRAMEF18Q5VWM3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRAMEF18Q5VWM3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRAMEF18Q5VWM3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRAMEF18Q5VWM3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PRAMEF18Q5VWM3 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PRAMEF18Q5VWM3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PRAMEF18Q5VWM3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PRAMEF18Q5VWM3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PRAMEF18Q5VWM3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRAMEF18Q5VWM3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRAMEF18Q5VWM3 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRAMEF18Q5VWM3 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
PRAMEF18Q5VWM3 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRAMEF18Q5VWM3 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
PRAMEF18Q5VWM3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRAMEF18Q5VWM3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRAMEF18Q5VWM3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRAMEF18Q5VWM3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRAMEF18Q5VWM3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRAMEF18Q5VWM3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRAMEF18Q5VWM3 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
PRAMEF18Q5VWM3 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PRAMEF18Q5VWM3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRAMEF18Q5VWM3 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRAMEF18Q5VWM3 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRAMEF18Q5VWM3 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRAMEF18Q5VWM3 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
PRAMEF18Q5VWM3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRAMEF18Q5VWM3 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRAMEF18Q5VWM3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PRAMEF18Q5VWM3 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
PRAMEF18Q5VWM3 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PRAMEF18Q5VWM3 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PRAMEF18Q5VWM3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PRAMEF18Q5VWM3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PRAMEF18Q5VWM3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PRAMEF18Q5VWM3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRAMEF18Q5VWM3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRAMEF18Q5VWM3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRAMEF18Q5VWM3 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRAMEF18Q5VWM3 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRAMEF18Q5VWM3 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRAMEF18Q5VWM3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRAMEF18Q5VWM3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRAMEF18Q5VWM3 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRAMEF18Q5VWM3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRAMEF18Q5VWM3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRAMEF18Q5VWM3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRAMEF18Q5VWM3 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRAMEF18Q5VWM3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRAMEF18Q5VWM3 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
PRAMEF18Q5VWM3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRAMEF18Q5VWM3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRAMEF18Q5VWM3 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRAMEF18Q5VWM3 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRAMEF18Q5VWM3 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRAMEF18Q5VWM3 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRAMEF18Q5VWM3 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRAMEF18Q5VWM3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRAMEF18Q5VWM3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRAMEF18Q5VWM3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRAMEF18Q5VWM3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRAMEF18Q5VWM3 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRAMEF18Q5VWM3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRAMEF18Q5VWM3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRAMEF18Q5VWM3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRAMEF18Q5VWM3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PRAMEF18Q5VWM3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PRAMEF18Q5VWM3 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PRAMEF18Q5VWM3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PRAMEF18Q5VWM3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PRAMEF18Q5VWM3 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
PRAMEF18Q5VWM3 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PRAMEF18Q5VWM3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRAMEF18Q5VWM3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRAMEF18Q5VWM3 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
PRAMEF18Q5VWM3 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
PRAMEF18Q5VWM3 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRAMEF18Q5VWM3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms