Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
C9orf135Q5VTT2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
C9orf135Q5VTT2 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
C9orf135Q5VTT2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
C9orf135Q5VTT2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
C9orf135Q5VTT2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
C9orf135Q5VTT2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
C9orf135Q5VTT2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
C9orf135Q5VTT2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
C9orf135Q5VTT2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
C9orf135Q5VTT2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
C9orf135Q5VTT2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
C9orf135Q5VTT2 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
C9orf135Q5VTT2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
C9orf135Q5VTT2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
C9orf135Q5VTT2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
C9orf135Q5VTT2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
C9orf135Q5VTT2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
C9orf135Q5VTT2 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
C9orf135Q5VTT2 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
C9orf135Q5VTT2 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
C9orf135Q5VTT2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
C9orf135Q5VTT2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
C9orf135Q5VTT2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
C9orf135Q5VTT2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
C9orf135Q5VTT2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
C9orf135Q5VTT2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
C9orf135Q5VTT2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
C9orf135Q5VTT2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
C9orf135Q5VTT2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
C9orf135Q5VTT2 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
C9orf135Q5VTT2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
C9orf135Q5VTT2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
C9orf135Q5VTT2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
C9orf135Q5VTT2 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
C9orf135Q5VTT2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
C9orf135Q5VTT2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
C9orf135Q5VTT2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
C9orf135Q5VTT2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
C9orf135Q5VTT2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
C9orf135Q5VTT2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
C9orf135Q5VTT2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
C9orf135Q5VTT2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
C9orf135Q5VTT2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
C9orf135Q5VTT2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
C9orf135Q5VTT2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
C9orf135Q5VTT2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
C9orf135Q5VTT2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
C9orf135Q5VTT2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
C9orf135Q5VTT2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
C9orf135Q5VTT2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
C9orf135Q5VTT2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
C9orf135Q5VTT2 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
C9orf135Q5VTT2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
C9orf135Q5VTT2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
C9orf135Q5VTT2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
C9orf135Q5VTT2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
C9orf135Q5VTT2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
C9orf135Q5VTT2 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
C9orf135Q5VTT2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
C9orf135Q5VTT2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
C9orf135Q5VTT2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
C9orf135Q5VTT2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
C9orf135Q5VTT2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
C9orf135Q5VTT2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
C9orf135Q5VTT2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
C9orf135Q5VTT2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
C9orf135Q5VTT2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
C9orf135Q5VTT2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
C9orf135Q5VTT2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
C9orf135Q5VTT2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
C9orf135Q5VTT2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
C9orf135Q5VTT2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
C9orf135Q5VTT2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
C9orf135Q5VTT2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
C9orf135Q5VTT2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
C9orf135Q5VTT2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
C9orf135Q5VTT2 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
C9orf135Q5VTT2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
C9orf135Q5VTT2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
C9orf135Q5VTT2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
C9orf135Q5VTT2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
C9orf135Q5VTT2 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
C9orf135Q5VTT2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
C9orf135Q5VTT2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
C9orf135Q5VTT2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
C9orf135Q5VTT2 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
C9orf135Q5VTT2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
C9orf135Q5VTT2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
C9orf135Q5VTT2 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
C9orf135Q5VTT2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
C9orf135Q5VTT2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
C9orf135Q5VTT2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
C9orf135Q5VTT2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
C9orf135Q5VTT2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
C9orf135Q5VTT2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
C9orf135Q5VTT2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
C9orf135Q5VTT2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
C9orf135Q5VTT2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
C9orf135Q5VTT2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms