Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTM2

AGAP9, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP9Q5VTM2 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
AGAP9Q5VTM2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
AGAP9Q5VTM2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
AGAP9Q5VTM2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AGAP9Q5VTM2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AGAP9Q5VTM2 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AGAP9Q5VTM2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AGAP9Q5VTM2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
AGAP9Q5VTM2 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
AGAP9Q5VTM2 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
AGAP9Q5VTM2 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AGAP9Q5VTM2 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AGAP9Q5VTM2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AGAP9Q5VTM2 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
AGAP9Q5VTM2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AGAP9Q5VTM2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AGAP9Q5VTM2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
AGAP9Q5VTM2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
AGAP9Q5VTM2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AGAP9Q5VTM2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AGAP9Q5VTM2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AGAP9Q5VTM2 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
AGAP9Q5VTM2 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
AGAP9Q5VTM2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
AGAP9Q5VTM2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AGAP9Q5VTM2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
AGAP9Q5VTM2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
AGAP9Q5VTM2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
AGAP9Q5VTM2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
AGAP9Q5VTM2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AGAP9Q5VTM2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AGAP9Q5VTM2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
AGAP9Q5VTM2 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
AGAP9Q5VTM2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
AGAP9Q5VTM2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AGAP9Q5VTM2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AGAP9Q5VTM2 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AGAP9Q5VTM2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
AGAP9Q5VTM2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AGAP9Q5VTM2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AGAP9Q5VTM2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
AGAP9Q5VTM2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
AGAP9Q5VTM2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AGAP9Q5VTM2 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
AGAP9Q5VTM2 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AGAP9Q5VTM2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AGAP9Q5VTM2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AGAP9Q5VTM2 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
AGAP9Q5VTM2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AGAP9Q5VTM2 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
AGAP9Q5VTM2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
AGAP9Q5VTM2 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AGAP9Q5VTM2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
AGAP9Q5VTM2 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AGAP9Q5VTM2 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
AGAP9Q5VTM2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
AGAP9Q5VTM2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
AGAP9Q5VTM2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AGAP9Q5VTM2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
AGAP9Q5VTM2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AGAP9Q5VTM2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AGAP9Q5VTM2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AGAP9Q5VTM2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AGAP9Q5VTM2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AGAP9Q5VTM2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
AGAP9Q5VTM2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AGAP9Q5VTM2 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
AGAP9Q5VTM2 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AGAP9Q5VTM2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AGAP9Q5VTM2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AGAP9Q5VTM2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AGAP9Q5VTM2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AGAP9Q5VTM2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AGAP9Q5VTM2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AGAP9Q5VTM2 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
AGAP9Q5VTM2 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
AGAP9Q5VTM2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
AGAP9Q5VTM2 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AGAP9Q5VTM2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AGAP9Q5VTM2 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
AGAP9Q5VTM2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AGAP9Q5VTM2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AGAP9Q5VTM2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
AGAP9Q5VTM2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AGAP9Q5VTM2 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
AGAP9Q5VTM2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
AGAP9Q5VTM2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
AGAP9Q5VTM2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
AGAP9Q5VTM2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AGAP9Q5VTM2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AGAP9Q5VTM2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AGAP9Q5VTM2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AGAP9Q5VTM2 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AGAP9Q5VTM2 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
AGAP9Q5VTM2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AGAP9Q5VTM2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
AGAP9Q5VTM2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AGAP9Q5VTM2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AGAP9Q5VTM2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
AGAP9Q5VTM2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.3 ms