Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTH9

WDR78, WD repeat-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR78Q5VTH9 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
WDR78Q5VTH9 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
WDR78Q5VTH9 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
WDR78Q5VTH9 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
WDR78Q5VTH9 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
WDR78Q5VTH9 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
WDR78Q5VTH9 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
WDR78Q5VTH9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
WDR78Q5VTH9 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
WDR78Q5VTH9 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
WDR78Q5VTH9 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
WDR78Q5VTH9 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
WDR78Q5VTH9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
WDR78Q5VTH9 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
WDR78Q5VTH9 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
WDR78Q5VTH9 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
WDR78Q5VTH9 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
WDR78Q5VTH9 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
WDR78Q5VTH9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
WDR78Q5VTH9 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
WDR78Q5VTH9 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
WDR78Q5VTH9 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
WDR78Q5VTH9 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
WDR78Q5VTH9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
WDR78Q5VTH9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
WDR78Q5VTH9 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
WDR78Q5VTH9 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
WDR78Q5VTH9 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
WDR78Q5VTH9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
WDR78Q5VTH9 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
WDR78Q5VTH9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
WDR78Q5VTH9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
WDR78Q5VTH9 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
WDR78Q5VTH9 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
WDR78Q5VTH9 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
WDR78Q5VTH9 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
WDR78Q5VTH9 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
WDR78Q5VTH9 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
WDR78Q5VTH9 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
WDR78Q5VTH9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
WDR78Q5VTH9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
WDR78Q5VTH9 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
WDR78Q5VTH9 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
WDR78Q5VTH9 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
WDR78Q5VTH9 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
WDR78Q5VTH9 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
WDR78Q5VTH9 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
WDR78Q5VTH9 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
WDR78Q5VTH9 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
WDR78Q5VTH9 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
WDR78Q5VTH9 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
WDR78Q5VTH9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
WDR78Q5VTH9 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
WDR78Q5VTH9 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
WDR78Q5VTH9 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
WDR78Q5VTH9 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
WDR78Q5VTH9 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
WDR78Q5VTH9 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
WDR78Q5VTH9 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
WDR78Q5VTH9 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
WDR78Q5VTH9 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
WDR78Q5VTH9 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
WDR78Q5VTH9 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
WDR78Q5VTH9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
WDR78Q5VTH9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
WDR78Q5VTH9 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
WDR78Q5VTH9 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
WDR78Q5VTH9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
WDR78Q5VTH9 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
WDR78Q5VTH9 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
WDR78Q5VTH9 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
WDR78Q5VTH9 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
WDR78Q5VTH9 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
WDR78Q5VTH9 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
WDR78Q5VTH9 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
WDR78Q5VTH9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
WDR78Q5VTH9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
WDR78Q5VTH9 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
WDR78Q5VTH9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
WDR78Q5VTH9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
WDR78Q5VTH9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
WDR78Q5VTH9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
WDR78Q5VTH9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
WDR78Q5VTH9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
WDR78Q5VTH9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
WDR78Q5VTH9 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
WDR78Q5VTH9 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
WDR78Q5VTH9 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
WDR78Q5VTH9 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
WDR78Q5VTH9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
WDR78Q5VTH9 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
WDR78Q5VTH9 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
WDR78Q5VTH9 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
WDR78Q5VTH9 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
WDR78Q5VTH9 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
WDR78Q5VTH9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
WDR78Q5VTH9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
WDR78Q5VTH9 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
WDR78Q5VTH9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
WDR78Q5VTH9 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms