Protein–RNA interactions for Protein: Q5TAH2

SLC9C2, Sodium/hydrogen exchanger 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9C2Q5TAH2 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
SLC9C2Q5TAH2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SLC9C2Q5TAH2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SLC9C2Q5TAH2 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
SLC9C2Q5TAH2 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SLC9C2Q5TAH2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
SLC9C2Q5TAH2 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SLC9C2Q5TAH2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SLC9C2Q5TAH2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SLC9C2Q5TAH2 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SLC9C2Q5TAH2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SLC9C2Q5TAH2 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SLC9C2Q5TAH2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
SLC9C2Q5TAH2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SLC9C2Q5TAH2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SLC9C2Q5TAH2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SLC9C2Q5TAH2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SLC9C2Q5TAH2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SLC9C2Q5TAH2 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SLC9C2Q5TAH2 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
SLC9C2Q5TAH2 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SLC9C2Q5TAH2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SLC9C2Q5TAH2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SLC9C2Q5TAH2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
SLC9C2Q5TAH2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SLC9C2Q5TAH2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SLC9C2Q5TAH2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SLC9C2Q5TAH2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SLC9C2Q5TAH2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SLC9C2Q5TAH2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SLC9C2Q5TAH2 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SLC9C2Q5TAH2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SLC9C2Q5TAH2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SLC9C2Q5TAH2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SLC9C2Q5TAH2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SLC9C2Q5TAH2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SLC9C2Q5TAH2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SLC9C2Q5TAH2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
SLC9C2Q5TAH2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SLC9C2Q5TAH2 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SLC9C2Q5TAH2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SLC9C2Q5TAH2 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SLC9C2Q5TAH2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SLC9C2Q5TAH2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SLC9C2Q5TAH2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SLC9C2Q5TAH2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
SLC9C2Q5TAH2 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SLC9C2Q5TAH2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SLC9C2Q5TAH2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SLC9C2Q5TAH2 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SLC9C2Q5TAH2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SLC9C2Q5TAH2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SLC9C2Q5TAH2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SLC9C2Q5TAH2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
SLC9C2Q5TAH2 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SLC9C2Q5TAH2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SLC9C2Q5TAH2 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SLC9C2Q5TAH2 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SLC9C2Q5TAH2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SLC9C2Q5TAH2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SLC9C2Q5TAH2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SLC9C2Q5TAH2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SLC9C2Q5TAH2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SLC9C2Q5TAH2 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
SLC9C2Q5TAH2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SLC9C2Q5TAH2 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SLC9C2Q5TAH2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SLC9C2Q5TAH2 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SLC9C2Q5TAH2 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
SLC9C2Q5TAH2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SLC9C2Q5TAH2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SLC9C2Q5TAH2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SLC9C2Q5TAH2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SLC9C2Q5TAH2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SLC9C2Q5TAH2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SLC9C2Q5TAH2 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SLC9C2Q5TAH2 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SLC9C2Q5TAH2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SLC9C2Q5TAH2 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SLC9C2Q5TAH2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SLC9C2Q5TAH2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SLC9C2Q5TAH2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SLC9C2Q5TAH2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SLC9C2Q5TAH2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SLC9C2Q5TAH2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SLC9C2Q5TAH2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SLC9C2Q5TAH2 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SLC9C2Q5TAH2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SLC9C2Q5TAH2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SLC9C2Q5TAH2 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SLC9C2Q5TAH2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
SLC9C2Q5TAH2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SLC9C2Q5TAH2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SLC9C2Q5TAH2 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SLC9C2Q5TAH2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SLC9C2Q5TAH2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SLC9C2Q5TAH2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SLC9C2Q5TAH2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SLC9C2Q5TAH2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SLC9C2Q5TAH2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms