Protein–RNA interactions for Protein: Q5T7P8

SYT6, Synaptotagmin-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 510 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT6Q5T7P8 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYT6Q5T7P8 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYT6Q5T7P8 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYT6Q5T7P8 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYT6Q5T7P8 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYT6Q5T7P8 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYT6Q5T7P8 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYT6Q5T7P8 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYT6Q5T7P8 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
SYT6Q5T7P8 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
SYT6Q5T7P8 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYT6Q5T7P8 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYT6Q5T7P8 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYT6Q5T7P8 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYT6Q5T7P8 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYT6Q5T7P8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYT6Q5T7P8 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SYT6Q5T7P8 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SYT6Q5T7P8 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SYT6Q5T7P8 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SYT6Q5T7P8 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SYT6Q5T7P8 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SYT6Q5T7P8 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SYT6Q5T7P8 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SYT6Q5T7P8 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SYT6Q5T7P8 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SYT6Q5T7P8 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SYT6Q5T7P8 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SYT6Q5T7P8 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SYT6Q5T7P8 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SYT6Q5T7P8 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SYT6Q5T7P8 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SYT6Q5T7P8 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SYT6Q5T7P8 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SYT6Q5T7P8 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SYT6Q5T7P8 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SYT6Q5T7P8 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SYT6Q5T7P8 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SYT6Q5T7P8 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SYT6Q5T7P8 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SYT6Q5T7P8 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SYT6Q5T7P8 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SYT6Q5T7P8 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SYT6Q5T7P8 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SYT6Q5T7P8 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SYT6Q5T7P8 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SYT6Q5T7P8 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SYT6Q5T7P8 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SYT6Q5T7P8 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SYT6Q5T7P8 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SYT6Q5T7P8 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SYT6Q5T7P8 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SYT6Q5T7P8 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SYT6Q5T7P8 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYT6Q5T7P8 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYT6Q5T7P8 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYT6Q5T7P8 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYT6Q5T7P8 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYT6Q5T7P8 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYT6Q5T7P8 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYT6Q5T7P8 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYT6Q5T7P8 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYT6Q5T7P8 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYT6Q5T7P8 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYT6Q5T7P8 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYT6Q5T7P8 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYT6Q5T7P8 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SYT6Q5T7P8 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYT6Q5T7P8 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYT6Q5T7P8 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYT6Q5T7P8 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYT6Q5T7P8 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYT6Q5T7P8 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYT6Q5T7P8 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYT6Q5T7P8 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYT6Q5T7P8 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYT6Q5T7P8 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYT6Q5T7P8 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYT6Q5T7P8 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYT6Q5T7P8 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYT6Q5T7P8 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYT6Q5T7P8 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYT6Q5T7P8 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYT6Q5T7P8 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SYT6Q5T7P8 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYT6Q5T7P8 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYT6Q5T7P8 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYT6Q5T7P8 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYT6Q5T7P8 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYT6Q5T7P8 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYT6Q5T7P8 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYT6Q5T7P8 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYT6Q5T7P8 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYT6Q5T7P8 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYT6Q5T7P8 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYT6Q5T7P8 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYT6Q5T7P8 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYT6Q5T7P8 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYT6Q5T7P8 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYT6Q5T7P8 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms