Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2R2

PDSS1, Decaprenyl-diphosphate synthase subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDSS1Q5T2R2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDSS1Q5T2R2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDSS1Q5T2R2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDSS1Q5T2R2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDSS1Q5T2R2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDSS1Q5T2R2 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDSS1Q5T2R2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDSS1Q5T2R2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDSS1Q5T2R2 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PDSS1Q5T2R2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDSS1Q5T2R2 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDSS1Q5T2R2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDSS1Q5T2R2 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PDSS1Q5T2R2 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PDSS1Q5T2R2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDSS1Q5T2R2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDSS1Q5T2R2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PDSS1Q5T2R2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PDSS1Q5T2R2 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDSS1Q5T2R2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDSS1Q5T2R2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDSS1Q5T2R2 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PDSS1Q5T2R2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDSS1Q5T2R2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDSS1Q5T2R2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDSS1Q5T2R2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDSS1Q5T2R2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PDSS1Q5T2R2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PDSS1Q5T2R2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PDSS1Q5T2R2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PDSS1Q5T2R2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDSS1Q5T2R2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDSS1Q5T2R2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PDSS1Q5T2R2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PDSS1Q5T2R2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PDSS1Q5T2R2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PDSS1Q5T2R2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PDSS1Q5T2R2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDSS1Q5T2R2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDSS1Q5T2R2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDSS1Q5T2R2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PDSS1Q5T2R2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PDSS1Q5T2R2 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PDSS1Q5T2R2 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDSS1Q5T2R2 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PDSS1Q5T2R2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDSS1Q5T2R2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDSS1Q5T2R2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDSS1Q5T2R2 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PDSS1Q5T2R2 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PDSS1Q5T2R2 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PDSS1Q5T2R2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PDSS1Q5T2R2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PDSS1Q5T2R2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDSS1Q5T2R2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDSS1Q5T2R2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDSS1Q5T2R2 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDSS1Q5T2R2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDSS1Q5T2R2 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDSS1Q5T2R2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDSS1Q5T2R2 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDSS1Q5T2R2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDSS1Q5T2R2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDSS1Q5T2R2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDSS1Q5T2R2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDSS1Q5T2R2 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDSS1Q5T2R2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDSS1Q5T2R2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDSS1Q5T2R2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDSS1Q5T2R2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDSS1Q5T2R2 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDSS1Q5T2R2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDSS1Q5T2R2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDSS1Q5T2R2 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PDSS1Q5T2R2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDSS1Q5T2R2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDSS1Q5T2R2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PDSS1Q5T2R2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDSS1Q5T2R2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDSS1Q5T2R2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDSS1Q5T2R2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDSS1Q5T2R2 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDSS1Q5T2R2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDSS1Q5T2R2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDSS1Q5T2R2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDSS1Q5T2R2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDSS1Q5T2R2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDSS1Q5T2R2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDSS1Q5T2R2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDSS1Q5T2R2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDSS1Q5T2R2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDSS1Q5T2R2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDSS1Q5T2R2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDSS1Q5T2R2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDSS1Q5T2R2 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDSS1Q5T2R2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDSS1Q5T2R2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDSS1Q5T2R2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDSS1Q5T2R2 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDSS1Q5T2R2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms