Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV4

BRMS1L, Breast cancer metastasis-suppressor 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1LQ5PSV4 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRMS1LQ5PSV4 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRMS1LQ5PSV4 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRMS1LQ5PSV4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRMS1LQ5PSV4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BRMS1LQ5PSV4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BRMS1LQ5PSV4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BRMS1LQ5PSV4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BRMS1LQ5PSV4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BRMS1LQ5PSV4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BRMS1LQ5PSV4 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BRMS1LQ5PSV4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BRMS1LQ5PSV4 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BRMS1LQ5PSV4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRMS1LQ5PSV4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRMS1LQ5PSV4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRMS1LQ5PSV4 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRMS1LQ5PSV4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRMS1LQ5PSV4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRMS1LQ5PSV4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRMS1LQ5PSV4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRMS1LQ5PSV4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRMS1LQ5PSV4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRMS1LQ5PSV4 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BRMS1LQ5PSV4 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
BRMS1LQ5PSV4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BRMS1LQ5PSV4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
BRMS1LQ5PSV4 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BRMS1LQ5PSV4 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BRMS1LQ5PSV4 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BRMS1LQ5PSV4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BRMS1LQ5PSV4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BRMS1LQ5PSV4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BRMS1LQ5PSV4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BRMS1LQ5PSV4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BRMS1LQ5PSV4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BRMS1LQ5PSV4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BRMS1LQ5PSV4 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
BRMS1LQ5PSV4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BRMS1LQ5PSV4 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BRMS1LQ5PSV4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BRMS1LQ5PSV4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BRMS1LQ5PSV4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BRMS1LQ5PSV4 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BRMS1LQ5PSV4 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BRMS1LQ5PSV4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
BRMS1LQ5PSV4 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BRMS1LQ5PSV4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BRMS1LQ5PSV4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BRMS1LQ5PSV4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BRMS1LQ5PSV4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BRMS1LQ5PSV4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BRMS1LQ5PSV4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BRMS1LQ5PSV4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BRMS1LQ5PSV4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BRMS1LQ5PSV4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BRMS1LQ5PSV4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BRMS1LQ5PSV4 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BRMS1LQ5PSV4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BRMS1LQ5PSV4 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BRMS1LQ5PSV4 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BRMS1LQ5PSV4 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
BRMS1LQ5PSV4 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BRMS1LQ5PSV4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BRMS1LQ5PSV4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BRMS1LQ5PSV4 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BRMS1LQ5PSV4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BRMS1LQ5PSV4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BRMS1LQ5PSV4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BRMS1LQ5PSV4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
BRMS1LQ5PSV4 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BRMS1LQ5PSV4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BRMS1LQ5PSV4 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BRMS1LQ5PSV4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BRMS1LQ5PSV4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BRMS1LQ5PSV4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BRMS1LQ5PSV4 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
BRMS1LQ5PSV4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
BRMS1LQ5PSV4 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
BRMS1LQ5PSV4 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
BRMS1LQ5PSV4 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
BRMS1LQ5PSV4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
BRMS1LQ5PSV4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
BRMS1LQ5PSV4 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
BRMS1LQ5PSV4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
BRMS1LQ5PSV4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
BRMS1LQ5PSV4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRMS1LQ5PSV4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRMS1LQ5PSV4 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRMS1LQ5PSV4 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
BRMS1LQ5PSV4 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRMS1LQ5PSV4 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BRMS1LQ5PSV4 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BRMS1LQ5PSV4 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BRMS1LQ5PSV4 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
BRMS1LQ5PSV4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
BRMS1LQ5PSV4 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BRMS1LQ5PSV4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BRMS1LQ5PSV4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BRMS1LQ5PSV4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms