Protein–RNA interactions for Protein: Q5J8X5

MS4A13, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 13, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A13Q5J8X5 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MS4A13Q5J8X5 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MS4A13Q5J8X5 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MS4A13Q5J8X5 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MS4A13Q5J8X5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MS4A13Q5J8X5 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MS4A13Q5J8X5 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MS4A13Q5J8X5 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
MS4A13Q5J8X5 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MS4A13Q5J8X5 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MS4A13Q5J8X5 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MS4A13Q5J8X5 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MS4A13Q5J8X5 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MS4A13Q5J8X5 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MS4A13Q5J8X5 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MS4A13Q5J8X5 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MS4A13Q5J8X5 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MS4A13Q5J8X5 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MS4A13Q5J8X5 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MS4A13Q5J8X5 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MS4A13Q5J8X5 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MS4A13Q5J8X5 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MS4A13Q5J8X5 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MS4A13Q5J8X5 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
MS4A13Q5J8X5 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MS4A13Q5J8X5 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MS4A13Q5J8X5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MS4A13Q5J8X5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MS4A13Q5J8X5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MS4A13Q5J8X5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MS4A13Q5J8X5 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MS4A13Q5J8X5 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MS4A13Q5J8X5 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
MS4A13Q5J8X5 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MS4A13Q5J8X5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MS4A13Q5J8X5 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MS4A13Q5J8X5 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
MS4A13Q5J8X5 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MS4A13Q5J8X5 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MS4A13Q5J8X5 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
MS4A13Q5J8X5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MS4A13Q5J8X5 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MS4A13Q5J8X5 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MS4A13Q5J8X5 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
MS4A13Q5J8X5 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MS4A13Q5J8X5 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MS4A13Q5J8X5 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MS4A13Q5J8X5 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MS4A13Q5J8X5 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MS4A13Q5J8X5 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MS4A13Q5J8X5 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MS4A13Q5J8X5 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MS4A13Q5J8X5 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MS4A13Q5J8X5 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MS4A13Q5J8X5 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MS4A13Q5J8X5 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MS4A13Q5J8X5 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
MS4A13Q5J8X5 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MS4A13Q5J8X5 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MS4A13Q5J8X5 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MS4A13Q5J8X5 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MS4A13Q5J8X5 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MS4A13Q5J8X5 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
MS4A13Q5J8X5 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MS4A13Q5J8X5 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MS4A13Q5J8X5 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MS4A13Q5J8X5 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MS4A13Q5J8X5 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MS4A13Q5J8X5 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MS4A13Q5J8X5 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MS4A13Q5J8X5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MS4A13Q5J8X5 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
MS4A13Q5J8X5 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
MS4A13Q5J8X5 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MS4A13Q5J8X5 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MS4A13Q5J8X5 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MS4A13Q5J8X5 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MS4A13Q5J8X5 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MS4A13Q5J8X5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MS4A13Q5J8X5 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MS4A13Q5J8X5 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MS4A13Q5J8X5 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MS4A13Q5J8X5 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MS4A13Q5J8X5 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MS4A13Q5J8X5 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MS4A13Q5J8X5 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MS4A13Q5J8X5 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MS4A13Q5J8X5 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MS4A13Q5J8X5 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MS4A13Q5J8X5 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MS4A13Q5J8X5 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MS4A13Q5J8X5 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MS4A13Q5J8X5 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MS4A13Q5J8X5 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
MS4A13Q5J8X5 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MS4A13Q5J8X5 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MS4A13Q5J8X5 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MS4A13Q5J8X5 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MS4A13Q5J8X5 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MS4A13Q5J8X5 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms