Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RFTN2Q52LD8 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RFTN2Q52LD8 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RFTN2Q52LD8 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RFTN2Q52LD8 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RFTN2Q52LD8 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RFTN2Q52LD8 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RFTN2Q52LD8 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RFTN2Q52LD8 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RFTN2Q52LD8 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RFTN2Q52LD8 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RFTN2Q52LD8 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RFTN2Q52LD8 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RFTN2Q52LD8 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RFTN2Q52LD8 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RFTN2Q52LD8 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RFTN2Q52LD8 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RFTN2Q52LD8 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RFTN2Q52LD8 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RFTN2Q52LD8 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RFTN2Q52LD8 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RFTN2Q52LD8 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RFTN2Q52LD8 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RFTN2Q52LD8 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RFTN2Q52LD8 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RFTN2Q52LD8 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RFTN2Q52LD8 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RFTN2Q52LD8 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RFTN2Q52LD8 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RFTN2Q52LD8 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RFTN2Q52LD8 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RFTN2Q52LD8 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RFTN2Q52LD8 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RFTN2Q52LD8 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RFTN2Q52LD8 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RFTN2Q52LD8 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RFTN2Q52LD8 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RFTN2Q52LD8 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RFTN2Q52LD8 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RFTN2Q52LD8 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RFTN2Q52LD8 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RFTN2Q52LD8 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RFTN2Q52LD8 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RFTN2Q52LD8 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RFTN2Q52LD8 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RFTN2Q52LD8 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RFTN2Q52LD8 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RFTN2Q52LD8 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RFTN2Q52LD8 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RFTN2Q52LD8 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RFTN2Q52LD8 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RFTN2Q52LD8 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RFTN2Q52LD8 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RFTN2Q52LD8 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RFTN2Q52LD8 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RFTN2Q52LD8 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RFTN2Q52LD8 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RFTN2Q52LD8 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RFTN2Q52LD8 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RFTN2Q52LD8 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RFTN2Q52LD8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RFTN2Q52LD8 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RFTN2Q52LD8 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RFTN2Q52LD8 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RFTN2Q52LD8 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RFTN2Q52LD8 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RFTN2Q52LD8 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RFTN2Q52LD8 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RFTN2Q52LD8 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RFTN2Q52LD8 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RFTN2Q52LD8 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RFTN2Q52LD8 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RFTN2Q52LD8 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RFTN2Q52LD8 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RFTN2Q52LD8 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
RFTN2Q52LD8 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RFTN2Q52LD8 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RFTN2Q52LD8 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RFTN2Q52LD8 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RFTN2Q52LD8 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RFTN2Q52LD8 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RFTN2Q52LD8 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RFTN2Q52LD8 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RFTN2Q52LD8 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RFTN2Q52LD8 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RFTN2Q52LD8 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RFTN2Q52LD8 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RFTN2Q52LD8 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RFTN2Q52LD8 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RFTN2Q52LD8 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RFTN2Q52LD8 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RFTN2Q52LD8 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RFTN2Q52LD8 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RFTN2Q52LD8 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RFTN2Q52LD8 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RFTN2Q52LD8 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RFTN2Q52LD8 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RFTN2Q52LD8 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RFTN2Q52LD8 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RFTN2Q52LD8 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms