Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

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Length 711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TPRNQ4KMQ1 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
TPRNQ4KMQ1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TPRNQ4KMQ1 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TPRNQ4KMQ1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TPRNQ4KMQ1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TPRNQ4KMQ1 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TPRNQ4KMQ1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TPRNQ4KMQ1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TPRNQ4KMQ1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TPRNQ4KMQ1 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TPRNQ4KMQ1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TPRNQ4KMQ1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TPRNQ4KMQ1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
TPRNQ4KMQ1 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TPRNQ4KMQ1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TPRNQ4KMQ1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TPRNQ4KMQ1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TPRNQ4KMQ1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TPRNQ4KMQ1 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TPRNQ4KMQ1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TPRNQ4KMQ1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TPRNQ4KMQ1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TPRNQ4KMQ1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TPRNQ4KMQ1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TPRNQ4KMQ1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TPRNQ4KMQ1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TPRNQ4KMQ1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TPRNQ4KMQ1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TPRNQ4KMQ1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TPRNQ4KMQ1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TPRNQ4KMQ1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TPRNQ4KMQ1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TPRNQ4KMQ1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TPRNQ4KMQ1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TPRNQ4KMQ1 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TPRNQ4KMQ1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TPRNQ4KMQ1 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TPRNQ4KMQ1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TPRNQ4KMQ1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TPRNQ4KMQ1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TPRNQ4KMQ1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TPRNQ4KMQ1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
TPRNQ4KMQ1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TPRNQ4KMQ1 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TPRNQ4KMQ1 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TPRNQ4KMQ1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TPRNQ4KMQ1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TPRNQ4KMQ1 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TPRNQ4KMQ1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TPRNQ4KMQ1 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TPRNQ4KMQ1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TPRNQ4KMQ1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TPRNQ4KMQ1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TPRNQ4KMQ1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TPRNQ4KMQ1 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TPRNQ4KMQ1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TPRNQ4KMQ1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TPRNQ4KMQ1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TPRNQ4KMQ1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TPRNQ4KMQ1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TPRNQ4KMQ1 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TPRNQ4KMQ1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TPRNQ4KMQ1 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TPRNQ4KMQ1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TPRNQ4KMQ1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TPRNQ4KMQ1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
TPRNQ4KMQ1 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TPRNQ4KMQ1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TPRNQ4KMQ1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TPRNQ4KMQ1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TPRNQ4KMQ1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TPRNQ4KMQ1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TPRNQ4KMQ1 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TPRNQ4KMQ1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TPRNQ4KMQ1 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TPRNQ4KMQ1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TPRNQ4KMQ1 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TPRNQ4KMQ1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
TPRNQ4KMQ1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TPRNQ4KMQ1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TPRNQ4KMQ1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TPRNQ4KMQ1 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TPRNQ4KMQ1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TPRNQ4KMQ1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TPRNQ4KMQ1 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TPRNQ4KMQ1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TPRNQ4KMQ1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TPRNQ4KMQ1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TPRNQ4KMQ1 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TPRNQ4KMQ1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TPRNQ4KMQ1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TPRNQ4KMQ1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TPRNQ4KMQ1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TPRNQ4KMQ1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TPRNQ4KMQ1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TPRNQ4KMQ1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TPRNQ4KMQ1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TPRNQ4KMQ1 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TPRNQ4KMQ1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
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