Protein–RNA interactions for Protein: Q3MHD2

LSM12, Protein LSM12 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM12Q3MHD2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LSM12Q3MHD2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LSM12Q3MHD2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LSM12Q3MHD2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LSM12Q3MHD2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LSM12Q3MHD2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LSM12Q3MHD2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LSM12Q3MHD2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LSM12Q3MHD2 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LSM12Q3MHD2 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
LSM12Q3MHD2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LSM12Q3MHD2 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LSM12Q3MHD2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LSM12Q3MHD2 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LSM12Q3MHD2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LSM12Q3MHD2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LSM12Q3MHD2 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LSM12Q3MHD2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LSM12Q3MHD2 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LSM12Q3MHD2 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LSM12Q3MHD2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LSM12Q3MHD2 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LSM12Q3MHD2 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LSM12Q3MHD2 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LSM12Q3MHD2 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LSM12Q3MHD2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LSM12Q3MHD2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LSM12Q3MHD2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LSM12Q3MHD2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LSM12Q3MHD2 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LSM12Q3MHD2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LSM12Q3MHD2 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LSM12Q3MHD2 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LSM12Q3MHD2 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LSM12Q3MHD2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LSM12Q3MHD2 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
LSM12Q3MHD2 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LSM12Q3MHD2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LSM12Q3MHD2 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LSM12Q3MHD2 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
LSM12Q3MHD2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
LSM12Q3MHD2 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LSM12Q3MHD2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
LSM12Q3MHD2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LSM12Q3MHD2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LSM12Q3MHD2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LSM12Q3MHD2 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LSM12Q3MHD2 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LSM12Q3MHD2 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LSM12Q3MHD2 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LSM12Q3MHD2 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LSM12Q3MHD2 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LSM12Q3MHD2 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LSM12Q3MHD2 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LSM12Q3MHD2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LSM12Q3MHD2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LSM12Q3MHD2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LSM12Q3MHD2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LSM12Q3MHD2 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LSM12Q3MHD2 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LSM12Q3MHD2 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LSM12Q3MHD2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LSM12Q3MHD2 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LSM12Q3MHD2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LSM12Q3MHD2 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LSM12Q3MHD2 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LSM12Q3MHD2 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LSM12Q3MHD2 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LSM12Q3MHD2 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LSM12Q3MHD2 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LSM12Q3MHD2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LSM12Q3MHD2 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LSM12Q3MHD2 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LSM12Q3MHD2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LSM12Q3MHD2 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LSM12Q3MHD2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LSM12Q3MHD2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LSM12Q3MHD2 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LSM12Q3MHD2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LSM12Q3MHD2 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LSM12Q3MHD2 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LSM12Q3MHD2 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LSM12Q3MHD2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LSM12Q3MHD2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LSM12Q3MHD2 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LSM12Q3MHD2 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LSM12Q3MHD2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LSM12Q3MHD2 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LSM12Q3MHD2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LSM12Q3MHD2 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LSM12Q3MHD2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LSM12Q3MHD2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LSM12Q3MHD2 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LSM12Q3MHD2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LSM12Q3MHD2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LSM12Q3MHD2 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LSM12Q3MHD2 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LSM12Q3MHD2 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LSM12Q3MHD2 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LSM12Q3MHD2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms