Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV2

NBPF8, Putative neuroblastoma breakpoint family member 8, humanhuman

Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF8Q3BBV2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
NBPF8Q3BBV2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
NBPF8Q3BBV2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
NBPF8Q3BBV2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
NBPF8Q3BBV2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
NBPF8Q3BBV2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
NBPF8Q3BBV2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
NBPF8Q3BBV2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
NBPF8Q3BBV2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
NBPF8Q3BBV2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
NBPF8Q3BBV2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
NBPF8Q3BBV2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
NBPF8Q3BBV2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
NBPF8Q3BBV2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
NBPF8Q3BBV2 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
NBPF8Q3BBV2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
NBPF8Q3BBV2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
NBPF8Q3BBV2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
NBPF8Q3BBV2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
NBPF8Q3BBV2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
NBPF8Q3BBV2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC33.8■■■■□ 3
NBPF8Q3BBV2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC33.8■■■■□ 3
NBPF8Q3BBV2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
NBPF8Q3BBV2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
NBPF8Q3BBV2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC33.79■■■■□ 3
NBPF8Q3BBV2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
NBPF8Q3BBV2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
NBPF8Q3BBV2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
NBPF8Q3BBV2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
NBPF8Q3BBV2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
NBPF8Q3BBV2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
NBPF8Q3BBV2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
NBPF8Q3BBV2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
NBPF8Q3BBV2 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC33.78■■■■□ 3
NBPF8Q3BBV2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
NBPF8Q3BBV2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
NBPF8Q3BBV2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
NBPF8Q3BBV2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
NBPF8Q3BBV2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
NBPF8Q3BBV2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
NBPF8Q3BBV2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
NBPF8Q3BBV2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
NBPF8Q3BBV2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
NBPF8Q3BBV2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
NBPF8Q3BBV2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC33.76■■■■□ 3
NBPF8Q3BBV2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
NBPF8Q3BBV2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
NBPF8Q3BBV2 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.75■■■□□ 2.99
NBPF8Q3BBV2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
NBPF8Q3BBV2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
NBPF8Q3BBV2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
NBPF8Q3BBV2 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
NBPF8Q3BBV2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
NBPF8Q3BBV2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
NBPF8Q3BBV2 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
NBPF8Q3BBV2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
NBPF8Q3BBV2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
NBPF8Q3BBV2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
NBPF8Q3BBV2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
NBPF8Q3BBV2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
NBPF8Q3BBV2 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
NBPF8Q3BBV2 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC33.72■■■□□ 2.99
NBPF8Q3BBV2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
NBPF8Q3BBV2 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
NBPF8Q3BBV2 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
NBPF8Q3BBV2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC33.71■■■□□ 2.99
NBPF8Q3BBV2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
NBPF8Q3BBV2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
NBPF8Q3BBV2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
NBPF8Q3BBV2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.98
NBPF8Q3BBV2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
NBPF8Q3BBV2 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
NBPF8Q3BBV2 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
NBPF8Q3BBV2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
NBPF8Q3BBV2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
NBPF8Q3BBV2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
NBPF8Q3BBV2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
NBPF8Q3BBV2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
NBPF8Q3BBV2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
NBPF8Q3BBV2 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
NBPF8Q3BBV2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
NBPF8Q3BBV2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
NBPF8Q3BBV2 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
NBPF8Q3BBV2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
NBPF8Q3BBV2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
NBPF8Q3BBV2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
NBPF8Q3BBV2 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
NBPF8Q3BBV2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
NBPF8Q3BBV2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
NBPF8Q3BBV2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
NBPF8Q3BBV2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
NBPF8Q3BBV2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
NBPF8Q3BBV2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
NBPF8Q3BBV2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
NBPF8Q3BBV2 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
NBPF8Q3BBV2 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
NBPF8Q3BBV2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
NBPF8Q3BBV2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
NBPF8Q3BBV2 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
NBPF8Q3BBV2 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms