Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPK5

CTU2, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2Q2VPK5 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTU2Q2VPK5 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTU2Q2VPK5 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTU2Q2VPK5 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTU2Q2VPK5 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTU2Q2VPK5 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTU2Q2VPK5 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTU2Q2VPK5 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTU2Q2VPK5 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTU2Q2VPK5 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTU2Q2VPK5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTU2Q2VPK5 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTU2Q2VPK5 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTU2Q2VPK5 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTU2Q2VPK5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTU2Q2VPK5 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTU2Q2VPK5 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTU2Q2VPK5 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTU2Q2VPK5 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTU2Q2VPK5 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTU2Q2VPK5 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CTU2Q2VPK5 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTU2Q2VPK5 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTU2Q2VPK5 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTU2Q2VPK5 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTU2Q2VPK5 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTU2Q2VPK5 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTU2Q2VPK5 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTU2Q2VPK5 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTU2Q2VPK5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTU2Q2VPK5 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CTU2Q2VPK5 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTU2Q2VPK5 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTU2Q2VPK5 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CTU2Q2VPK5 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTU2Q2VPK5 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTU2Q2VPK5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTU2Q2VPK5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTU2Q2VPK5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTU2Q2VPK5 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTU2Q2VPK5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTU2Q2VPK5 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CTU2Q2VPK5 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTU2Q2VPK5 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CTU2Q2VPK5 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTU2Q2VPK5 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTU2Q2VPK5 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTU2Q2VPK5 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTU2Q2VPK5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTU2Q2VPK5 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CTU2Q2VPK5 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTU2Q2VPK5 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTU2Q2VPK5 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTU2Q2VPK5 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTU2Q2VPK5 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTU2Q2VPK5 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTU2Q2VPK5 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTU2Q2VPK5 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTU2Q2VPK5 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTU2Q2VPK5 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTU2Q2VPK5 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTU2Q2VPK5 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTU2Q2VPK5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTU2Q2VPK5 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTU2Q2VPK5 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CTU2Q2VPK5 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTU2Q2VPK5 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTU2Q2VPK5 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTU2Q2VPK5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTU2Q2VPK5 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTU2Q2VPK5 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTU2Q2VPK5 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CTU2Q2VPK5 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTU2Q2VPK5 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTU2Q2VPK5 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CTU2Q2VPK5 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTU2Q2VPK5 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CTU2Q2VPK5 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTU2Q2VPK5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTU2Q2VPK5 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTU2Q2VPK5 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTU2Q2VPK5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTU2Q2VPK5 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTU2Q2VPK5 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTU2Q2VPK5 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTU2Q2VPK5 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CTU2Q2VPK5 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CTU2Q2VPK5 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTU2Q2VPK5 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTU2Q2VPK5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTU2Q2VPK5 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTU2Q2VPK5 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTU2Q2VPK5 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTU2Q2VPK5 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTU2Q2VPK5 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTU2Q2VPK5 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTU2Q2VPK5 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTU2Q2VPK5 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTU2Q2VPK5 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTU2Q2VPK5 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms