Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NDUFA9Q16795 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NDUFA9Q16795 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
NDUFA9Q16795 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NDUFA9Q16795 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NDUFA9Q16795 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NDUFA9Q16795 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
NDUFA9Q16795 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NDUFA9Q16795 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NDUFA9Q16795 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NDUFA9Q16795 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NDUFA9Q16795 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NDUFA9Q16795 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NDUFA9Q16795 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NDUFA9Q16795 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NDUFA9Q16795 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NDUFA9Q16795 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NDUFA9Q16795 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NDUFA9Q16795 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NDUFA9Q16795 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NDUFA9Q16795 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NDUFA9Q16795 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NDUFA9Q16795 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NDUFA9Q16795 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NDUFA9Q16795 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NDUFA9Q16795 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NDUFA9Q16795 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NDUFA9Q16795 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NDUFA9Q16795 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NDUFA9Q16795 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NDUFA9Q16795 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
NDUFA9Q16795 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NDUFA9Q16795 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NDUFA9Q16795 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NDUFA9Q16795 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NDUFA9Q16795 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NDUFA9Q16795 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NDUFA9Q16795 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NDUFA9Q16795 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NDUFA9Q16795 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NDUFA9Q16795 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NDUFA9Q16795 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NDUFA9Q16795 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NDUFA9Q16795 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NDUFA9Q16795 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NDUFA9Q16795 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NDUFA9Q16795 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NDUFA9Q16795 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NDUFA9Q16795 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NDUFA9Q16795 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NDUFA9Q16795 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NDUFA9Q16795 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NDUFA9Q16795 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NDUFA9Q16795 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NDUFA9Q16795 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NDUFA9Q16795 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NDUFA9Q16795 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NDUFA9Q16795 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NDUFA9Q16795 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NDUFA9Q16795 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NDUFA9Q16795 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NDUFA9Q16795 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NDUFA9Q16795 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NDUFA9Q16795 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NDUFA9Q16795 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NDUFA9Q16795 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NDUFA9Q16795 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NDUFA9Q16795 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NDUFA9Q16795 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NDUFA9Q16795 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NDUFA9Q16795 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NDUFA9Q16795 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NDUFA9Q16795 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NDUFA9Q16795 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NDUFA9Q16795 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NDUFA9Q16795 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NDUFA9Q16795 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NDUFA9Q16795 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NDUFA9Q16795 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NDUFA9Q16795 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NDUFA9Q16795 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NDUFA9Q16795 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NDUFA9Q16795 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NDUFA9Q16795 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NDUFA9Q16795 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NDUFA9Q16795 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NDUFA9Q16795 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NDUFA9Q16795 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NDUFA9Q16795 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NDUFA9Q16795 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NDUFA9Q16795 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NDUFA9Q16795 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NDUFA9Q16795 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NDUFA9Q16795 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NDUFA9Q16795 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NDUFA9Q16795 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NDUFA9Q16795 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NDUFA9Q16795 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NDUFA9Q16795 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NDUFA9Q16795 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
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