Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPE65Q16518 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPE65Q16518 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
RPE65Q16518 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPE65Q16518 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPE65Q16518 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPE65Q16518 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPE65Q16518 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPE65Q16518 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPE65Q16518 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPE65Q16518 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPE65Q16518 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPE65Q16518 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RPE65Q16518 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPE65Q16518 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPE65Q16518 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RPE65Q16518 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23■■□□□ 1.27
RPE65Q16518 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RPE65Q16518 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RPE65Q16518 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RPE65Q16518 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RPE65Q16518 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPE65Q16518 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPE65Q16518 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPE65Q16518 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPE65Q16518 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPE65Q16518 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPE65Q16518 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPE65Q16518 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPE65Q16518 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPE65Q16518 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPE65Q16518 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPE65Q16518 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPE65Q16518 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPE65Q16518 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPE65Q16518 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPE65Q16518 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPE65Q16518 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPE65Q16518 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPE65Q16518 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPE65Q16518 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPE65Q16518 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPE65Q16518 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPE65Q16518 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPE65Q16518 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPE65Q16518 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPE65Q16518 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPE65Q16518 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPE65Q16518 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPE65Q16518 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPE65Q16518 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPE65Q16518 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RPE65Q16518 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPE65Q16518 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPE65Q16518 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPE65Q16518 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPE65Q16518 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPE65Q16518 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPE65Q16518 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPE65Q16518 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPE65Q16518 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RPE65Q16518 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPE65Q16518 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPE65Q16518 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPE65Q16518 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPE65Q16518 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPE65Q16518 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPE65Q16518 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPE65Q16518 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPE65Q16518 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPE65Q16518 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPE65Q16518 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPE65Q16518 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPE65Q16518 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPE65Q16518 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPE65Q16518 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RPE65Q16518 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPE65Q16518 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPE65Q16518 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPE65Q16518 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPE65Q16518 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPE65Q16518 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPE65Q16518 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPE65Q16518 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
RPE65Q16518 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RPE65Q16518 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPE65Q16518 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
RPE65Q16518 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPE65Q16518 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPE65Q16518 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPE65Q16518 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPE65Q16518 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPE65Q16518 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPE65Q16518 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPE65Q16518 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPE65Q16518 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPE65Q16518 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPE65Q16518 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RPE65Q16518 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RPE65Q16518 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
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