Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
GRIK5Q16478 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
GRIK5Q16478 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
GRIK5Q16478 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
GRIK5Q16478 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
GRIK5Q16478 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
GRIK5Q16478 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
GRIK5Q16478 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
GRIK5Q16478 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
GRIK5Q16478 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
GRIK5Q16478 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
GRIK5Q16478 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
GRIK5Q16478 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
GRIK5Q16478 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
GRIK5Q16478 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
GRIK5Q16478 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
GRIK5Q16478 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
GRIK5Q16478 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
GRIK5Q16478 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
GRIK5Q16478 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
GRIK5Q16478 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GRIK5Q16478 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
GRIK5Q16478 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GRIK5Q16478 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
GRIK5Q16478 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GRIK5Q16478 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GRIK5Q16478 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
GRIK5Q16478 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
GRIK5Q16478 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
GRIK5Q16478 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GRIK5Q16478 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
GRIK5Q16478 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
GRIK5Q16478 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
GRIK5Q16478 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
GRIK5Q16478 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
GRIK5Q16478 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
GRIK5Q16478 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
GRIK5Q16478 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
GRIK5Q16478 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
GRIK5Q16478 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
GRIK5Q16478 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
GRIK5Q16478 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
GRIK5Q16478 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
GRIK5Q16478 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
GRIK5Q16478 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
GRIK5Q16478 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
GRIK5Q16478 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
GRIK5Q16478 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
GRIK5Q16478 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
GRIK5Q16478 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GRIK5Q16478 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
GRIK5Q16478 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
GRIK5Q16478 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GRIK5Q16478 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GRIK5Q16478 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GRIK5Q16478 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GRIK5Q16478 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
GRIK5Q16478 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
GRIK5Q16478 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GRIK5Q16478 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GRIK5Q16478 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
GRIK5Q16478 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
GRIK5Q16478 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GRIK5Q16478 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
GRIK5Q16478 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
GRIK5Q16478 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC28.51■■■□□ 2.15
GRIK5Q16478 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
GRIK5Q16478 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
GRIK5Q16478 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
GRIK5Q16478 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
GRIK5Q16478 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
GRIK5Q16478 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
GRIK5Q16478 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GRIK5Q16478 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
GRIK5Q16478 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
GRIK5Q16478 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GRIK5Q16478 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
GRIK5Q16478 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GRIK5Q16478 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GRIK5Q16478 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GRIK5Q16478 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GRIK5Q16478 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
GRIK5Q16478 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GRIK5Q16478 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GRIK5Q16478 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
GRIK5Q16478 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
GRIK5Q16478 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
GRIK5Q16478 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GRIK5Q16478 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
GRIK5Q16478 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
GRIK5Q16478 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
GRIK5Q16478 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
GRIK5Q16478 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
GRIK5Q16478 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
GRIK5Q16478 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
GRIK5Q16478 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
GRIK5Q16478 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GRIK5Q16478 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GRIK5Q16478 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GRIK5Q16478 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
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