Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

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Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP6AP1Q15904 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP6AP1Q15904 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP6AP1Q15904 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP6AP1Q15904 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP6AP1Q15904 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP6AP1Q15904 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP6AP1Q15904 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP6AP1Q15904 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP6AP1Q15904 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP6AP1Q15904 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP6AP1Q15904 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP6AP1Q15904 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP6AP1Q15904 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP6AP1Q15904 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP6AP1Q15904 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP6AP1Q15904 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP6AP1Q15904 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP6AP1Q15904 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP6AP1Q15904 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP6AP1Q15904 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP6AP1Q15904 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP6AP1Q15904 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP6AP1Q15904 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP6AP1Q15904 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP6AP1Q15904 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP6AP1Q15904 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP6AP1Q15904 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP6AP1Q15904 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
ATP6AP1Q15904 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP6AP1Q15904 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP6AP1Q15904 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP6AP1Q15904 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP6AP1Q15904 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP6AP1Q15904 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP6AP1Q15904 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP6AP1Q15904 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP6AP1Q15904 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP6AP1Q15904 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP6AP1Q15904 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP6AP1Q15904 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP6AP1Q15904 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP6AP1Q15904 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP6AP1Q15904 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP6AP1Q15904 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP6AP1Q15904 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP6AP1Q15904 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP6AP1Q15904 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP6AP1Q15904 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP6AP1Q15904 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP6AP1Q15904 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP6AP1Q15904 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP6AP1Q15904 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP6AP1Q15904 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP6AP1Q15904 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP6AP1Q15904 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP6AP1Q15904 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP6AP1Q15904 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP6AP1Q15904 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP6AP1Q15904 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP6AP1Q15904 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP6AP1Q15904 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP6AP1Q15904 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP6AP1Q15904 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP6AP1Q15904 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP6AP1Q15904 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP6AP1Q15904 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP6AP1Q15904 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP6AP1Q15904 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP6AP1Q15904 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP6AP1Q15904 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP6AP1Q15904 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP6AP1Q15904 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP6AP1Q15904 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP6AP1Q15904 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP6AP1Q15904 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP6AP1Q15904 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP6AP1Q15904 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP6AP1Q15904 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP6AP1Q15904 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ATP6AP1Q15904 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ATP6AP1Q15904 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATP6AP1Q15904 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATP6AP1Q15904 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATP6AP1Q15904 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATP6AP1Q15904 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ATP6AP1Q15904 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATP6AP1Q15904 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATP6AP1Q15904 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATP6AP1Q15904 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATP6AP1Q15904 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP6AP1Q15904 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP6AP1Q15904 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP6AP1Q15904 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP6AP1Q15904 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP6AP1Q15904 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP6AP1Q15904 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP6AP1Q15904 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP6AP1Q15904 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP6AP1Q15904 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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