Protein–RNA interactions for Protein: Q15846

CLUL1, Clusterin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLUL1Q15846 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLUL1Q15846 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CLUL1Q15846 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLUL1Q15846 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLUL1Q15846 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLUL1Q15846 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLUL1Q15846 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLUL1Q15846 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLUL1Q15846 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLUL1Q15846 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLUL1Q15846 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLUL1Q15846 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLUL1Q15846 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CLUL1Q15846 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLUL1Q15846 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLUL1Q15846 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLUL1Q15846 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLUL1Q15846 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLUL1Q15846 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLUL1Q15846 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLUL1Q15846 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLUL1Q15846 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLUL1Q15846 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CLUL1Q15846 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CLUL1Q15846 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLUL1Q15846 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLUL1Q15846 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLUL1Q15846 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLUL1Q15846 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLUL1Q15846 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLUL1Q15846 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLUL1Q15846 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLUL1Q15846 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLUL1Q15846 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLUL1Q15846 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLUL1Q15846 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLUL1Q15846 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLUL1Q15846 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLUL1Q15846 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLUL1Q15846 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLUL1Q15846 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLUL1Q15846 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLUL1Q15846 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLUL1Q15846 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLUL1Q15846 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CLUL1Q15846 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLUL1Q15846 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLUL1Q15846 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLUL1Q15846 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLUL1Q15846 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLUL1Q15846 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLUL1Q15846 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLUL1Q15846 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLUL1Q15846 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLUL1Q15846 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLUL1Q15846 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLUL1Q15846 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLUL1Q15846 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CLUL1Q15846 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CLUL1Q15846 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLUL1Q15846 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLUL1Q15846 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLUL1Q15846 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CLUL1Q15846 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLUL1Q15846 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLUL1Q15846 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLUL1Q15846 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLUL1Q15846 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLUL1Q15846 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLUL1Q15846 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLUL1Q15846 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLUL1Q15846 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLUL1Q15846 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLUL1Q15846 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLUL1Q15846 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLUL1Q15846 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLUL1Q15846 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLUL1Q15846 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLUL1Q15846 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLUL1Q15846 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLUL1Q15846 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLUL1Q15846 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLUL1Q15846 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLUL1Q15846 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLUL1Q15846 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLUL1Q15846 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLUL1Q15846 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLUL1Q15846 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLUL1Q15846 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLUL1Q15846 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLUL1Q15846 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLUL1Q15846 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLUL1Q15846 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLUL1Q15846 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CLUL1Q15846 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CLUL1Q15846 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CLUL1Q15846 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CLUL1Q15846 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CLUL1Q15846 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CLUL1Q15846 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms