Protein–RNA interactions for Protein: Q15526

SURF1, Surfeit locus protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SURF1Q15526 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SURF1Q15526 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SURF1Q15526 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SURF1Q15526 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SURF1Q15526 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SURF1Q15526 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SURF1Q15526 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SURF1Q15526 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SURF1Q15526 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SURF1Q15526 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SURF1Q15526 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SURF1Q15526 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SURF1Q15526 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SURF1Q15526 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SURF1Q15526 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SURF1Q15526 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SURF1Q15526 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SURF1Q15526 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SURF1Q15526 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SURF1Q15526 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SURF1Q15526 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SURF1Q15526 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SURF1Q15526 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SURF1Q15526 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SURF1Q15526 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SURF1Q15526 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SURF1Q15526 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SURF1Q15526 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SURF1Q15526 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SURF1Q15526 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SURF1Q15526 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SURF1Q15526 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SURF1Q15526 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SURF1Q15526 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SURF1Q15526 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SURF1Q15526 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SURF1Q15526 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SURF1Q15526 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SURF1Q15526 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SURF1Q15526 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SURF1Q15526 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SURF1Q15526 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SURF1Q15526 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SURF1Q15526 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SURF1Q15526 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SURF1Q15526 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SURF1Q15526 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SURF1Q15526 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SURF1Q15526 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SURF1Q15526 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SURF1Q15526 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SURF1Q15526 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SURF1Q15526 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SURF1Q15526 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SURF1Q15526 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SURF1Q15526 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SURF1Q15526 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SURF1Q15526 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SURF1Q15526 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SURF1Q15526 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SURF1Q15526 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SURF1Q15526 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SURF1Q15526 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SURF1Q15526 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SURF1Q15526 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SURF1Q15526 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SURF1Q15526 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SURF1Q15526 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SURF1Q15526 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SURF1Q15526 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SURF1Q15526 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SURF1Q15526 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SURF1Q15526 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SURF1Q15526 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SURF1Q15526 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SURF1Q15526 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SURF1Q15526 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SURF1Q15526 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SURF1Q15526 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SURF1Q15526 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SURF1Q15526 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SURF1Q15526 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SURF1Q15526 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SURF1Q15526 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SURF1Q15526 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SURF1Q15526 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SURF1Q15526 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SURF1Q15526 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SURF1Q15526 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SURF1Q15526 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SURF1Q15526 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SURF1Q15526 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SURF1Q15526 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SURF1Q15526 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SURF1Q15526 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SURF1Q15526 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SURF1Q15526 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SURF1Q15526 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SURF1Q15526 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SURF1Q15526 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
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